Protein–RNA interactions for Protein: Q9UID6

ZNF639, Zinc finger protein 639, humanhuman

Predictions only

Length 485 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF639Q9UID6 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF639Q9UID6 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF639Q9UID6 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF639Q9UID6 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF639Q9UID6 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF639Q9UID6 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF639Q9UID6 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF639Q9UID6 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF639Q9UID6 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF639Q9UID6 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF639Q9UID6 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF639Q9UID6 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF639Q9UID6 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF639Q9UID6 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF639Q9UID6 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF639Q9UID6 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF639Q9UID6 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF639Q9UID6 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF639Q9UID6 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF639Q9UID6 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF639Q9UID6 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF639Q9UID6 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNF639Q9UID6 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNF639Q9UID6 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNF639Q9UID6 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNF639Q9UID6 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNF639Q9UID6 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNF639Q9UID6 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNF639Q9UID6 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNF639Q9UID6 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNF639Q9UID6 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNF639Q9UID6 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNF639Q9UID6 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNF639Q9UID6 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF639Q9UID6 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF639Q9UID6 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF639Q9UID6 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF639Q9UID6 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF639Q9UID6 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF639Q9UID6 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF639Q9UID6 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF639Q9UID6 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF639Q9UID6 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF639Q9UID6 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF639Q9UID6 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF639Q9UID6 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF639Q9UID6 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF639Q9UID6 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF639Q9UID6 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.07
ZNF639Q9UID6 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
ZNF639Q9UID6 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
ZNF639Q9UID6 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF639Q9UID6 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF639Q9UID6 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF639Q9UID6 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF639Q9UID6 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF639Q9UID6 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF639Q9UID6 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF639Q9UID6 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF639Q9UID6 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF639Q9UID6 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF639Q9UID6 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF639Q9UID6 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF639Q9UID6 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF639Q9UID6 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF639Q9UID6 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF639Q9UID6 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF639Q9UID6 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF639Q9UID6 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF639Q9UID6 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF639Q9UID6 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF639Q9UID6 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF639Q9UID6 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF639Q9UID6 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF639Q9UID6 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF639Q9UID6 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF639Q9UID6 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF639Q9UID6 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF639Q9UID6 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF639Q9UID6 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF639Q9UID6 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNF639Q9UID6 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNF639Q9UID6 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNF639Q9UID6 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNF639Q9UID6 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF639Q9UID6 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF639Q9UID6 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF639Q9UID6 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF639Q9UID6 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF639Q9UID6 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF639Q9UID6 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF639Q9UID6 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF639Q9UID6 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF639Q9UID6 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF639Q9UID6 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF639Q9UID6 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZNF639Q9UID6 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZNF639Q9UID6 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZNF639Q9UID6 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZNF639Q9UID6 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.3 ms