Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHD1

CHORDC1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHORDC1Q9UHD1 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHORDC1Q9UHD1 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHORDC1Q9UHD1 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHORDC1Q9UHD1 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHORDC1Q9UHD1 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CHORDC1Q9UHD1 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHORDC1Q9UHD1 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHORDC1Q9UHD1 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHORDC1Q9UHD1 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHORDC1Q9UHD1 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHORDC1Q9UHD1 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHORDC1Q9UHD1 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHORDC1Q9UHD1 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHORDC1Q9UHD1 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHORDC1Q9UHD1 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHORDC1Q9UHD1 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHORDC1Q9UHD1 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHORDC1Q9UHD1 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHORDC1Q9UHD1 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHORDC1Q9UHD1 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHORDC1Q9UHD1 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHORDC1Q9UHD1 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHORDC1Q9UHD1 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHORDC1Q9UHD1 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHORDC1Q9UHD1 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHORDC1Q9UHD1 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHORDC1Q9UHD1 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHORDC1Q9UHD1 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHORDC1Q9UHD1 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CHORDC1Q9UHD1 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CHORDC1Q9UHD1 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CHORDC1Q9UHD1 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CHORDC1Q9UHD1 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CHORDC1Q9UHD1 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CHORDC1Q9UHD1 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CHORDC1Q9UHD1 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CHORDC1Q9UHD1 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CHORDC1Q9UHD1 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CHORDC1Q9UHD1 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CHORDC1Q9UHD1 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CHORDC1Q9UHD1 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CHORDC1Q9UHD1 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CHORDC1Q9UHD1 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHORDC1Q9UHD1 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHORDC1Q9UHD1 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHORDC1Q9UHD1 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHORDC1Q9UHD1 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHORDC1Q9UHD1 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHORDC1Q9UHD1 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHORDC1Q9UHD1 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHORDC1Q9UHD1 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHORDC1Q9UHD1 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHORDC1Q9UHD1 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHORDC1Q9UHD1 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHORDC1Q9UHD1 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHORDC1Q9UHD1 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHORDC1Q9UHD1 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHORDC1Q9UHD1 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHORDC1Q9UHD1 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHORDC1Q9UHD1 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CHORDC1Q9UHD1 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHORDC1Q9UHD1 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHORDC1Q9UHD1 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHORDC1Q9UHD1 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHORDC1Q9UHD1 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHORDC1Q9UHD1 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHORDC1Q9UHD1 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHORDC1Q9UHD1 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHORDC1Q9UHD1 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHORDC1Q9UHD1 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHORDC1Q9UHD1 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHORDC1Q9UHD1 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHORDC1Q9UHD1 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHORDC1Q9UHD1 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHORDC1Q9UHD1 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHORDC1Q9UHD1 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHORDC1Q9UHD1 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHORDC1Q9UHD1 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHORDC1Q9UHD1 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CHORDC1Q9UHD1 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CHORDC1Q9UHD1 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHORDC1Q9UHD1 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHORDC1Q9UHD1 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHORDC1Q9UHD1 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHORDC1Q9UHD1 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHORDC1Q9UHD1 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHORDC1Q9UHD1 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHORDC1Q9UHD1 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHORDC1Q9UHD1 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHORDC1Q9UHD1 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CHORDC1Q9UHD1 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHORDC1Q9UHD1 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CHORDC1Q9UHD1 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHORDC1Q9UHD1 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHORDC1Q9UHD1 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHORDC1Q9UHD1 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHORDC1Q9UHD1 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHORDC1Q9UHD1 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHORDC1Q9UHD1 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHORDC1Q9UHD1 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms