Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC6

CNTNAP2, Contactin-associated protein-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP2Q9UHC6 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CNTNAP2Q9UHC6 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CNTNAP2Q9UHC6 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CNTNAP2Q9UHC6 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CNTNAP2Q9UHC6 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CNTNAP2Q9UHC6 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CNTNAP2Q9UHC6 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CNTNAP2Q9UHC6 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CNTNAP2Q9UHC6 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CNTNAP2Q9UHC6 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CNTNAP2Q9UHC6 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CNTNAP2Q9UHC6 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CNTNAP2Q9UHC6 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CNTNAP2Q9UHC6 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CNTNAP2Q9UHC6 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CNTNAP2Q9UHC6 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CNTNAP2Q9UHC6 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CNTNAP2Q9UHC6 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CNTNAP2Q9UHC6 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CNTNAP2Q9UHC6 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CNTNAP2Q9UHC6 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CNTNAP2Q9UHC6 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CNTNAP2Q9UHC6 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CNTNAP2Q9UHC6 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CNTNAP2Q9UHC6 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CNTNAP2Q9UHC6 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CNTNAP2Q9UHC6 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CNTNAP2Q9UHC6 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CNTNAP2Q9UHC6 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CNTNAP2Q9UHC6 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CNTNAP2Q9UHC6 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CNTNAP2Q9UHC6 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CNTNAP2Q9UHC6 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CNTNAP2Q9UHC6 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CNTNAP2Q9UHC6 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CNTNAP2Q9UHC6 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CNTNAP2Q9UHC6 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CNTNAP2Q9UHC6 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CNTNAP2Q9UHC6 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CNTNAP2Q9UHC6 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CNTNAP2Q9UHC6 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CNTNAP2Q9UHC6 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CNTNAP2Q9UHC6 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CNTNAP2Q9UHC6 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CNTNAP2Q9UHC6 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CNTNAP2Q9UHC6 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CNTNAP2Q9UHC6 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CNTNAP2Q9UHC6 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CNTNAP2Q9UHC6 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CNTNAP2Q9UHC6 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CNTNAP2Q9UHC6 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CNTNAP2Q9UHC6 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CNTNAP2Q9UHC6 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CNTNAP2Q9UHC6 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CNTNAP2Q9UHC6 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CNTNAP2Q9UHC6 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CNTNAP2Q9UHC6 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CNTNAP2Q9UHC6 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CNTNAP2Q9UHC6 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CNTNAP2Q9UHC6 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CNTNAP2Q9UHC6 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CNTNAP2Q9UHC6 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNTNAP2Q9UHC6 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNTNAP2Q9UHC6 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNTNAP2Q9UHC6 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNTNAP2Q9UHC6 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNTNAP2Q9UHC6 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNTNAP2Q9UHC6 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNTNAP2Q9UHC6 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNTNAP2Q9UHC6 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNTNAP2Q9UHC6 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNTNAP2Q9UHC6 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNTNAP2Q9UHC6 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNTNAP2Q9UHC6 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CNTNAP2Q9UHC6 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNTNAP2Q9UHC6 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CNTNAP2Q9UHC6 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CNTNAP2Q9UHC6 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CNTNAP2Q9UHC6 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CNTNAP2Q9UHC6 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CNTNAP2Q9UHC6 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CNTNAP2Q9UHC6 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CNTNAP2Q9UHC6 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CNTNAP2Q9UHC6 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CNTNAP2Q9UHC6 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CNTNAP2Q9UHC6 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CNTNAP2Q9UHC6 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CNTNAP2Q9UHC6 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CNTNAP2Q9UHC6 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CNTNAP2Q9UHC6 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CNTNAP2Q9UHC6 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CNTNAP2Q9UHC6 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CNTNAP2Q9UHC6 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CNTNAP2Q9UHC6 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CNTNAP2Q9UHC6 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CNTNAP2Q9UHC6 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNTNAP2Q9UHC6 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNTNAP2Q9UHC6 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNTNAP2Q9UHC6 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNTNAP2Q9UHC6 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms