Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC3

ASIC3, Acid-sensing ion channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC3Q9UHC3 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ASIC3Q9UHC3 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ASIC3Q9UHC3 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ASIC3Q9UHC3 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ASIC3Q9UHC3 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ASIC3Q9UHC3 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ASIC3Q9UHC3 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ASIC3Q9UHC3 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ASIC3Q9UHC3 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ASIC3Q9UHC3 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ASIC3Q9UHC3 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ASIC3Q9UHC3 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
ASIC3Q9UHC3 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ASIC3Q9UHC3 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ASIC3Q9UHC3 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
ASIC3Q9UHC3 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ASIC3Q9UHC3 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ASIC3Q9UHC3 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
ASIC3Q9UHC3 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ASIC3Q9UHC3 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ASIC3Q9UHC3 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ASIC3Q9UHC3 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ASIC3Q9UHC3 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ASIC3Q9UHC3 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ASIC3Q9UHC3 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ASIC3Q9UHC3 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ASIC3Q9UHC3 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ASIC3Q9UHC3 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ASIC3Q9UHC3 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ASIC3Q9UHC3 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ASIC3Q9UHC3 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ASIC3Q9UHC3 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ASIC3Q9UHC3 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ASIC3Q9UHC3 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ASIC3Q9UHC3 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ASIC3Q9UHC3 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ASIC3Q9UHC3 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ASIC3Q9UHC3 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ASIC3Q9UHC3 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ASIC3Q9UHC3 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ASIC3Q9UHC3 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ASIC3Q9UHC3 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ASIC3Q9UHC3 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ASIC3Q9UHC3 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ASIC3Q9UHC3 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ASIC3Q9UHC3 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ASIC3Q9UHC3 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ASIC3Q9UHC3 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ASIC3Q9UHC3 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ASIC3Q9UHC3 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ASIC3Q9UHC3 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ASIC3Q9UHC3 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ASIC3Q9UHC3 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ASIC3Q9UHC3 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ASIC3Q9UHC3 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ASIC3Q9UHC3 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ASIC3Q9UHC3 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ASIC3Q9UHC3 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ASIC3Q9UHC3 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ASIC3Q9UHC3 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ASIC3Q9UHC3 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ASIC3Q9UHC3 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ASIC3Q9UHC3 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ASIC3Q9UHC3 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ASIC3Q9UHC3 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ASIC3Q9UHC3 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ASIC3Q9UHC3 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ASIC3Q9UHC3 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ASIC3Q9UHC3 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ASIC3Q9UHC3 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ASIC3Q9UHC3 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ASIC3Q9UHC3 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ASIC3Q9UHC3 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ASIC3Q9UHC3 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ASIC3Q9UHC3 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ASIC3Q9UHC3 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ASIC3Q9UHC3 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ASIC3Q9UHC3 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ASIC3Q9UHC3 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ASIC3Q9UHC3 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ASIC3Q9UHC3 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ASIC3Q9UHC3 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ASIC3Q9UHC3 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ASIC3Q9UHC3 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ASIC3Q9UHC3 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ASIC3Q9UHC3 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
ASIC3Q9UHC3 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ASIC3Q9UHC3 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
ASIC3Q9UHC3 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ASIC3Q9UHC3 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ASIC3Q9UHC3 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ASIC3Q9UHC3 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ASIC3Q9UHC3 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ASIC3Q9UHC3 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ASIC3Q9UHC3 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ASIC3Q9UHC3 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ASIC3Q9UHC3 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ASIC3Q9UHC3 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ASIC3Q9UHC3 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ASIC3Q9UHC3 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 202.9 ms