Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG63

ABCF2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF2Q9UG63 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
ABCF2Q9UG63 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ABCF2Q9UG63 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ABCF2Q9UG63 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ABCF2Q9UG63 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ABCF2Q9UG63 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ABCF2Q9UG63 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ABCF2Q9UG63 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ABCF2Q9UG63 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
ABCF2Q9UG63 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ABCF2Q9UG63 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ABCF2Q9UG63 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ABCF2Q9UG63 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ABCF2Q9UG63 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ABCF2Q9UG63 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ABCF2Q9UG63 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ABCF2Q9UG63 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ABCF2Q9UG63 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ABCF2Q9UG63 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
ABCF2Q9UG63 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
ABCF2Q9UG63 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ABCF2Q9UG63 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ABCF2Q9UG63 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ABCF2Q9UG63 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ABCF2Q9UG63 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ABCF2Q9UG63 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ABCF2Q9UG63 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ABCF2Q9UG63 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ABCF2Q9UG63 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ABCF2Q9UG63 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ABCF2Q9UG63 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ABCF2Q9UG63 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ABCF2Q9UG63 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ABCF2Q9UG63 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ABCF2Q9UG63 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ABCF2Q9UG63 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ABCF2Q9UG63 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ABCF2Q9UG63 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ABCF2Q9UG63 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ABCF2Q9UG63 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ABCF2Q9UG63 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ABCF2Q9UG63 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ABCF2Q9UG63 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ABCF2Q9UG63 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ABCF2Q9UG63 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ABCF2Q9UG63 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ABCF2Q9UG63 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
ABCF2Q9UG63 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ABCF2Q9UG63 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ABCF2Q9UG63 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
ABCF2Q9UG63 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
ABCF2Q9UG63 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
ABCF2Q9UG63 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ABCF2Q9UG63 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
ABCF2Q9UG63 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ABCF2Q9UG63 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ABCF2Q9UG63 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ABCF2Q9UG63 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC27.57■■■□□ 2
ABCF2Q9UG63 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
ABCF2Q9UG63 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC27.56■■■□□ 2
ABCF2Q9UG63 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
ABCF2Q9UG63 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
ABCF2Q9UG63 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
ABCF2Q9UG63 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
ABCF2Q9UG63 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
ABCF2Q9UG63 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC27.55■■■□□ 2
ABCF2Q9UG63 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ABCF2Q9UG63 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ABCF2Q9UG63 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ABCF2Q9UG63 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
ABCF2Q9UG63 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ABCF2Q9UG63 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ABCF2Q9UG63 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
ABCF2Q9UG63 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC27.54■■■□□ 2
ABCF2Q9UG63 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
ABCF2Q9UG63 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ABCF2Q9UG63 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ABCF2Q9UG63 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
ABCF2Q9UG63 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
ABCF2Q9UG63 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ABCF2Q9UG63 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC27.53■■■□□ 2
ABCF2Q9UG63 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
ABCF2Q9UG63 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
ABCF2Q9UG63 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ABCF2Q9UG63 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ABCF2Q9UG63 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ABCF2Q9UG63 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ABCF2Q9UG63 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC27.52■■■□□ 2
ABCF2Q9UG63 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ABCF2Q9UG63 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ABCF2Q9UG63 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ABCF2Q9UG63 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
ABCF2Q9UG63 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC27.52■■■□□ 2
ABCF2Q9UG63 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
ABCF2Q9UG63 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ABCF2Q9UG63 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
ABCF2Q9UG63 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC27.51■■■□□ 2
ABCF2Q9UG63 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ABCF2Q9UG63 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ABCF2Q9UG63 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms