Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT7

CTNNAL1, Alpha-catulin, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNAL1Q9UBT7 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTNNAL1Q9UBT7 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTNNAL1Q9UBT7 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTNNAL1Q9UBT7 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTNNAL1Q9UBT7 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTNNAL1Q9UBT7 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTNNAL1Q9UBT7 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTNNAL1Q9UBT7 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTNNAL1Q9UBT7 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTNNAL1Q9UBT7 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTNNAL1Q9UBT7 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTNNAL1Q9UBT7 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTNNAL1Q9UBT7 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTNNAL1Q9UBT7 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTNNAL1Q9UBT7 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTNNAL1Q9UBT7 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTNNAL1Q9UBT7 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTNNAL1Q9UBT7 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTNNAL1Q9UBT7 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTNNAL1Q9UBT7 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTNNAL1Q9UBT7 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTNNAL1Q9UBT7 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTNNAL1Q9UBT7 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CTNNAL1Q9UBT7 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTNNAL1Q9UBT7 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTNNAL1Q9UBT7 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTNNAL1Q9UBT7 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTNNAL1Q9UBT7 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTNNAL1Q9UBT7 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTNNAL1Q9UBT7 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTNNAL1Q9UBT7 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTNNAL1Q9UBT7 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTNNAL1Q9UBT7 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTNNAL1Q9UBT7 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTNNAL1Q9UBT7 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTNNAL1Q9UBT7 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTNNAL1Q9UBT7 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTNNAL1Q9UBT7 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTNNAL1Q9UBT7 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTNNAL1Q9UBT7 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTNNAL1Q9UBT7 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTNNAL1Q9UBT7 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTNNAL1Q9UBT7 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTNNAL1Q9UBT7 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTNNAL1Q9UBT7 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTNNAL1Q9UBT7 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTNNAL1Q9UBT7 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTNNAL1Q9UBT7 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTNNAL1Q9UBT7 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTNNAL1Q9UBT7 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTNNAL1Q9UBT7 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTNNAL1Q9UBT7 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTNNAL1Q9UBT7 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CTNNAL1Q9UBT7 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTNNAL1Q9UBT7 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CTNNAL1Q9UBT7 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CTNNAL1Q9UBT7 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CTNNAL1Q9UBT7 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTNNAL1Q9UBT7 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTNNAL1Q9UBT7 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTNNAL1Q9UBT7 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTNNAL1Q9UBT7 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTNNAL1Q9UBT7 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTNNAL1Q9UBT7 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTNNAL1Q9UBT7 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CTNNAL1Q9UBT7 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTNNAL1Q9UBT7 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTNNAL1Q9UBT7 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTNNAL1Q9UBT7 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTNNAL1Q9UBT7 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTNNAL1Q9UBT7 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTNNAL1Q9UBT7 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTNNAL1Q9UBT7 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTNNAL1Q9UBT7 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTNNAL1Q9UBT7 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTNNAL1Q9UBT7 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTNNAL1Q9UBT7 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTNNAL1Q9UBT7 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTNNAL1Q9UBT7 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTNNAL1Q9UBT7 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTNNAL1Q9UBT7 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTNNAL1Q9UBT7 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CTNNAL1Q9UBT7 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTNNAL1Q9UBT7 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CTNNAL1Q9UBT7 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTNNAL1Q9UBT7 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTNNAL1Q9UBT7 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTNNAL1Q9UBT7 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTNNAL1Q9UBT7 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTNNAL1Q9UBT7 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTNNAL1Q9UBT7 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTNNAL1Q9UBT7 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTNNAL1Q9UBT7 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTNNAL1Q9UBT7 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTNNAL1Q9UBT7 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTNNAL1Q9UBT7 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 220.7 ms