Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
POLKQ9UBT6 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
POLKQ9UBT6 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
POLKQ9UBT6 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
POLKQ9UBT6 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
POLKQ9UBT6 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
POLKQ9UBT6 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
POLKQ9UBT6 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC30.71■■■□□ 2.51
POLKQ9UBT6 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
POLKQ9UBT6 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
POLKQ9UBT6 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
POLKQ9UBT6 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
POLKQ9UBT6 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
POLKQ9UBT6 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
POLKQ9UBT6 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
POLKQ9UBT6 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.7■■■□□ 2.51
POLKQ9UBT6 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
POLKQ9UBT6 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC30.7■■■□□ 2.5
POLKQ9UBT6 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC30.69■■■□□ 2.5
POLKQ9UBT6 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
POLKQ9UBT6 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
POLKQ9UBT6 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC30.69■■■□□ 2.5
POLKQ9UBT6 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC30.69■■■□□ 2.5
POLKQ9UBT6 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
POLKQ9UBT6 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
POLKQ9UBT6 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
POLKQ9UBT6 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC30.68■■■□□ 2.5
POLKQ9UBT6 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
POLKQ9UBT6 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
POLKQ9UBT6 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
POLKQ9UBT6 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
POLKQ9UBT6 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
POLKQ9UBT6 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC30.68■■■□□ 2.5
POLKQ9UBT6 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
POLKQ9UBT6 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
POLKQ9UBT6 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
POLKQ9UBT6 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
POLKQ9UBT6 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
POLKQ9UBT6 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
POLKQ9UBT6 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
POLKQ9UBT6 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC30.67■■■□□ 2.5
POLKQ9UBT6 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
POLKQ9UBT6 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
POLKQ9UBT6 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
POLKQ9UBT6 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
POLKQ9UBT6 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
POLKQ9UBT6 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
POLKQ9UBT6 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.66■■■□□ 2.5
POLKQ9UBT6 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
POLKQ9UBT6 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
POLKQ9UBT6 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
POLKQ9UBT6 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
POLKQ9UBT6 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC30.65■■■□□ 2.5
POLKQ9UBT6 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
POLKQ9UBT6 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
POLKQ9UBT6 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
POLKQ9UBT6 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
POLKQ9UBT6 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
POLKQ9UBT6 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
POLKQ9UBT6 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
POLKQ9UBT6 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
POLKQ9UBT6 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
POLKQ9UBT6 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
POLKQ9UBT6 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
POLKQ9UBT6 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
POLKQ9UBT6 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
POLKQ9UBT6 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
POLKQ9UBT6 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
POLKQ9UBT6 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
POLKQ9UBT6 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
POLKQ9UBT6 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
POLKQ9UBT6 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
POLKQ9UBT6 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
POLKQ9UBT6 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
POLKQ9UBT6 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
POLKQ9UBT6 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
POLKQ9UBT6 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
POLKQ9UBT6 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
POLKQ9UBT6 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
POLKQ9UBT6 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
POLKQ9UBT6 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
POLKQ9UBT6 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
POLKQ9UBT6 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
POLKQ9UBT6 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC30.6■■■□□ 2.49
POLKQ9UBT6 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
POLKQ9UBT6 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
POLKQ9UBT6 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
POLKQ9UBT6 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
POLKQ9UBT6 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
POLKQ9UBT6 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
POLKQ9UBT6 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
POLKQ9UBT6 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC30.59■■■□□ 2.49
POLKQ9UBT6 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
POLKQ9UBT6 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
POLKQ9UBT6 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
POLKQ9UBT6 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
POLKQ9UBT6 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
POLKQ9UBT6 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC30.58■■■□□ 2.49
POLKQ9UBT6 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.58■■■□□ 2.49
POLKQ9UBT6 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms