Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBQ0

VPS29, Vacuolar protein sorting-associated protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS29Q9UBQ0 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
VPS29Q9UBQ0 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
VPS29Q9UBQ0 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
VPS29Q9UBQ0 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
VPS29Q9UBQ0 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VPS29Q9UBQ0 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
VPS29Q9UBQ0 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VPS29Q9UBQ0 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
VPS29Q9UBQ0 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
VPS29Q9UBQ0 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
VPS29Q9UBQ0 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
VPS29Q9UBQ0 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
VPS29Q9UBQ0 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
VPS29Q9UBQ0 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
VPS29Q9UBQ0 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
VPS29Q9UBQ0 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
VPS29Q9UBQ0 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
VPS29Q9UBQ0 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
VPS29Q9UBQ0 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
VPS29Q9UBQ0 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
VPS29Q9UBQ0 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
VPS29Q9UBQ0 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
VPS29Q9UBQ0 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
VPS29Q9UBQ0 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
VPS29Q9UBQ0 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
VPS29Q9UBQ0 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
VPS29Q9UBQ0 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
VPS29Q9UBQ0 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
VPS29Q9UBQ0 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
VPS29Q9UBQ0 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
VPS29Q9UBQ0 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
VPS29Q9UBQ0 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
VPS29Q9UBQ0 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
VPS29Q9UBQ0 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
VPS29Q9UBQ0 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
VPS29Q9UBQ0 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
VPS29Q9UBQ0 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
VPS29Q9UBQ0 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
VPS29Q9UBQ0 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
VPS29Q9UBQ0 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
VPS29Q9UBQ0 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
VPS29Q9UBQ0 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
VPS29Q9UBQ0 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
VPS29Q9UBQ0 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
VPS29Q9UBQ0 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
VPS29Q9UBQ0 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
VPS29Q9UBQ0 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
VPS29Q9UBQ0 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
VPS29Q9UBQ0 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
VPS29Q9UBQ0 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
VPS29Q9UBQ0 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
VPS29Q9UBQ0 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VPS29Q9UBQ0 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
VPS29Q9UBQ0 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VPS29Q9UBQ0 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
VPS29Q9UBQ0 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
VPS29Q9UBQ0 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VPS29Q9UBQ0 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VPS29Q9UBQ0 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
VPS29Q9UBQ0 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VPS29Q9UBQ0 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VPS29Q9UBQ0 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
VPS29Q9UBQ0 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
VPS29Q9UBQ0 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VPS29Q9UBQ0 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
VPS29Q9UBQ0 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VPS29Q9UBQ0 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VPS29Q9UBQ0 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VPS29Q9UBQ0 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
VPS29Q9UBQ0 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
VPS29Q9UBQ0 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
VPS29Q9UBQ0 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
VPS29Q9UBQ0 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
VPS29Q9UBQ0 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
VPS29Q9UBQ0 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
VPS29Q9UBQ0 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
VPS29Q9UBQ0 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VPS29Q9UBQ0 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VPS29Q9UBQ0 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
VPS29Q9UBQ0 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VPS29Q9UBQ0 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
VPS29Q9UBQ0 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
VPS29Q9UBQ0 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
VPS29Q9UBQ0 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
VPS29Q9UBQ0 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VPS29Q9UBQ0 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VPS29Q9UBQ0 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VPS29Q9UBQ0 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
VPS29Q9UBQ0 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
VPS29Q9UBQ0 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
VPS29Q9UBQ0 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
VPS29Q9UBQ0 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
VPS29Q9UBQ0 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
VPS29Q9UBQ0 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
VPS29Q9UBQ0 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
VPS29Q9UBQ0 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VPS29Q9UBQ0 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
VPS29Q9UBQ0 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VPS29Q9UBQ0 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VPS29Q9UBQ0 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 423.8 ms