Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN7

HDAC6, Histone deacetylase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC6Q9UBN7 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HDAC6Q9UBN7 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HDAC6Q9UBN7 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HDAC6Q9UBN7 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HDAC6Q9UBN7 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HDAC6Q9UBN7 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HDAC6Q9UBN7 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HDAC6Q9UBN7 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
HDAC6Q9UBN7 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
HDAC6Q9UBN7 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
HDAC6Q9UBN7 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
HDAC6Q9UBN7 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
HDAC6Q9UBN7 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HDAC6Q9UBN7 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HDAC6Q9UBN7 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HDAC6Q9UBN7 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HDAC6Q9UBN7 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HDAC6Q9UBN7 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HDAC6Q9UBN7 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
HDAC6Q9UBN7 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HDAC6Q9UBN7 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HDAC6Q9UBN7 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HDAC6Q9UBN7 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
HDAC6Q9UBN7 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HDAC6Q9UBN7 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HDAC6Q9UBN7 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HDAC6Q9UBN7 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HDAC6Q9UBN7 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HDAC6Q9UBN7 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HDAC6Q9UBN7 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
HDAC6Q9UBN7 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HDAC6Q9UBN7 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HDAC6Q9UBN7 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HDAC6Q9UBN7 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
HDAC6Q9UBN7 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HDAC6Q9UBN7 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HDAC6Q9UBN7 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HDAC6Q9UBN7 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HDAC6Q9UBN7 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HDAC6Q9UBN7 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HDAC6Q9UBN7 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HDAC6Q9UBN7 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HDAC6Q9UBN7 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HDAC6Q9UBN7 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HDAC6Q9UBN7 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HDAC6Q9UBN7 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HDAC6Q9UBN7 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HDAC6Q9UBN7 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
HDAC6Q9UBN7 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HDAC6Q9UBN7 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HDAC6Q9UBN7 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HDAC6Q9UBN7 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HDAC6Q9UBN7 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HDAC6Q9UBN7 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HDAC6Q9UBN7 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HDAC6Q9UBN7 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HDAC6Q9UBN7 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HDAC6Q9UBN7 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HDAC6Q9UBN7 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HDAC6Q9UBN7 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HDAC6Q9UBN7 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HDAC6Q9UBN7 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HDAC6Q9UBN7 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HDAC6Q9UBN7 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
HDAC6Q9UBN7 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
HDAC6Q9UBN7 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HDAC6Q9UBN7 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
HDAC6Q9UBN7 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HDAC6Q9UBN7 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
HDAC6Q9UBN7 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
HDAC6Q9UBN7 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
HDAC6Q9UBN7 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
HDAC6Q9UBN7 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
HDAC6Q9UBN7 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.69
HDAC6Q9UBN7 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
HDAC6Q9UBN7 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HDAC6Q9UBN7 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HDAC6Q9UBN7 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HDAC6Q9UBN7 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HDAC6Q9UBN7 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HDAC6Q9UBN7 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HDAC6Q9UBN7 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HDAC6Q9UBN7 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HDAC6Q9UBN7 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
HDAC6Q9UBN7 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HDAC6Q9UBN7 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HDAC6Q9UBN7 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HDAC6Q9UBN7 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HDAC6Q9UBN7 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HDAC6Q9UBN7 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HDAC6Q9UBN7 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HDAC6Q9UBN7 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HDAC6Q9UBN7 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HDAC6Q9UBN7 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HDAC6Q9UBN7 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HDAC6Q9UBN7 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
HDAC6Q9UBN7 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HDAC6Q9UBN7 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HDAC6Q9UBN7 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HDAC6Q9UBN7 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms