Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBK2

PPARGC1A, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1AQ9UBK2 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PPARGC1AQ9UBK2 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PPARGC1AQ9UBK2 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PPARGC1AQ9UBK2 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PPARGC1AQ9UBK2 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PPARGC1AQ9UBK2 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PPARGC1AQ9UBK2 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PPARGC1AQ9UBK2 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PPARGC1AQ9UBK2 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PPARGC1AQ9UBK2 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PPARGC1AQ9UBK2 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PPARGC1AQ9UBK2 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PPARGC1AQ9UBK2 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PPARGC1AQ9UBK2 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PPARGC1AQ9UBK2 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PPARGC1AQ9UBK2 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PPARGC1AQ9UBK2 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PPARGC1AQ9UBK2 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PPARGC1AQ9UBK2 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PPARGC1AQ9UBK2 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PPARGC1AQ9UBK2 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PPARGC1AQ9UBK2 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PPARGC1AQ9UBK2 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PPARGC1AQ9UBK2 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PPARGC1AQ9UBK2 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PPARGC1AQ9UBK2 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PPARGC1AQ9UBK2 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PPARGC1AQ9UBK2 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PPARGC1AQ9UBK2 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PPARGC1AQ9UBK2 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PPARGC1AQ9UBK2 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PPARGC1AQ9UBK2 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PPARGC1AQ9UBK2 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PPARGC1AQ9UBK2 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PPARGC1AQ9UBK2 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PPARGC1AQ9UBK2 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PPARGC1AQ9UBK2 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PPARGC1AQ9UBK2 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PPARGC1AQ9UBK2 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PPARGC1AQ9UBK2 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PPARGC1AQ9UBK2 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PPARGC1AQ9UBK2 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PPARGC1AQ9UBK2 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PPARGC1AQ9UBK2 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PPARGC1AQ9UBK2 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PPARGC1AQ9UBK2 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PPARGC1AQ9UBK2 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PPARGC1AQ9UBK2 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PPARGC1AQ9UBK2 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PPARGC1AQ9UBK2 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PPARGC1AQ9UBK2 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PPARGC1AQ9UBK2 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PPARGC1AQ9UBK2 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PPARGC1AQ9UBK2 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PPARGC1AQ9UBK2 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PPARGC1AQ9UBK2 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PPARGC1AQ9UBK2 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PPARGC1AQ9UBK2 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PPARGC1AQ9UBK2 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PPARGC1AQ9UBK2 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PPARGC1AQ9UBK2 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PPARGC1AQ9UBK2 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PPARGC1AQ9UBK2 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PPARGC1AQ9UBK2 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PPARGC1AQ9UBK2 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PPARGC1AQ9UBK2 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PPARGC1AQ9UBK2 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PPARGC1AQ9UBK2 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PPARGC1AQ9UBK2 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PPARGC1AQ9UBK2 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PPARGC1AQ9UBK2 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PPARGC1AQ9UBK2 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PPARGC1AQ9UBK2 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PPARGC1AQ9UBK2 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PPARGC1AQ9UBK2 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PPARGC1AQ9UBK2 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PPARGC1AQ9UBK2 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PPARGC1AQ9UBK2 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PPARGC1AQ9UBK2 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PPARGC1AQ9UBK2 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PPARGC1AQ9UBK2 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PPARGC1AQ9UBK2 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PPARGC1AQ9UBK2 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PPARGC1AQ9UBK2 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PPARGC1AQ9UBK2 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PPARGC1AQ9UBK2 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PPARGC1AQ9UBK2 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PPARGC1AQ9UBK2 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PPARGC1AQ9UBK2 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PPARGC1AQ9UBK2 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PPARGC1AQ9UBK2 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PPARGC1AQ9UBK2 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PPARGC1AQ9UBK2 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PPARGC1AQ9UBK2 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PPARGC1AQ9UBK2 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PPARGC1AQ9UBK2 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PPARGC1AQ9UBK2 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PPARGC1AQ9UBK2 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 539.1 ms