Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2I0

CPSF2, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPSF2Q9P2I0 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CPSF2Q9P2I0 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CPSF2Q9P2I0 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CPSF2Q9P2I0 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CPSF2Q9P2I0 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CPSF2Q9P2I0 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CPSF2Q9P2I0 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CPSF2Q9P2I0 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CPSF2Q9P2I0 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CPSF2Q9P2I0 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CPSF2Q9P2I0 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CPSF2Q9P2I0 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CPSF2Q9P2I0 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CPSF2Q9P2I0 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CPSF2Q9P2I0 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CPSF2Q9P2I0 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CPSF2Q9P2I0 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CPSF2Q9P2I0 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CPSF2Q9P2I0 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CPSF2Q9P2I0 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CPSF2Q9P2I0 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CPSF2Q9P2I0 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CPSF2Q9P2I0 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CPSF2Q9P2I0 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CPSF2Q9P2I0 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CPSF2Q9P2I0 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CPSF2Q9P2I0 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CPSF2Q9P2I0 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CPSF2Q9P2I0 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CPSF2Q9P2I0 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CPSF2Q9P2I0 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CPSF2Q9P2I0 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CPSF2Q9P2I0 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CPSF2Q9P2I0 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CPSF2Q9P2I0 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CPSF2Q9P2I0 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CPSF2Q9P2I0 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CPSF2Q9P2I0 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CPSF2Q9P2I0 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CPSF2Q9P2I0 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CPSF2Q9P2I0 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CPSF2Q9P2I0 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CPSF2Q9P2I0 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CPSF2Q9P2I0 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CPSF2Q9P2I0 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CPSF2Q9P2I0 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CPSF2Q9P2I0 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CPSF2Q9P2I0 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CPSF2Q9P2I0 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CPSF2Q9P2I0 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CPSF2Q9P2I0 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CPSF2Q9P2I0 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CPSF2Q9P2I0 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CPSF2Q9P2I0 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CPSF2Q9P2I0 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CPSF2Q9P2I0 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CPSF2Q9P2I0 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CPSF2Q9P2I0 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CPSF2Q9P2I0 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CPSF2Q9P2I0 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CPSF2Q9P2I0 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CPSF2Q9P2I0 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CPSF2Q9P2I0 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CPSF2Q9P2I0 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CPSF2Q9P2I0 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CPSF2Q9P2I0 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CPSF2Q9P2I0 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CPSF2Q9P2I0 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CPSF2Q9P2I0 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CPSF2Q9P2I0 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CPSF2Q9P2I0 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CPSF2Q9P2I0 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CPSF2Q9P2I0 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CPSF2Q9P2I0 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CPSF2Q9P2I0 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CPSF2Q9P2I0 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CPSF2Q9P2I0 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CPSF2Q9P2I0 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CPSF2Q9P2I0 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CPSF2Q9P2I0 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CPSF2Q9P2I0 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CPSF2Q9P2I0 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CPSF2Q9P2I0 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CPSF2Q9P2I0 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CPSF2Q9P2I0 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CPSF2Q9P2I0 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CPSF2Q9P2I0 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CPSF2Q9P2I0 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CPSF2Q9P2I0 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CPSF2Q9P2I0 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CPSF2Q9P2I0 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CPSF2Q9P2I0 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CPSF2Q9P2I0 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CPSF2Q9P2I0 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CPSF2Q9P2I0 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CPSF2Q9P2I0 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CPSF2Q9P2I0 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CPSF2Q9P2I0 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CPSF2Q9P2I0 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CPSF2Q9P2I0 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms