Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E8

MARCH4, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCH4Q9P2E8 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MARCH4Q9P2E8 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MARCH4Q9P2E8 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MARCH4Q9P2E8 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MARCH4Q9P2E8 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MARCH4Q9P2E8 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MARCH4Q9P2E8 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MARCH4Q9P2E8 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MARCH4Q9P2E8 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MARCH4Q9P2E8 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MARCH4Q9P2E8 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MARCH4Q9P2E8 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MARCH4Q9P2E8 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MARCH4Q9P2E8 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MARCH4Q9P2E8 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MARCH4Q9P2E8 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MARCH4Q9P2E8 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
MARCH4Q9P2E8 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MARCH4Q9P2E8 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MARCH4Q9P2E8 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
MARCH4Q9P2E8 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MARCH4Q9P2E8 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MARCH4Q9P2E8 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MARCH4Q9P2E8 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MARCH4Q9P2E8 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MARCH4Q9P2E8 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MARCH4Q9P2E8 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MARCH4Q9P2E8 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MARCH4Q9P2E8 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MARCH4Q9P2E8 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MARCH4Q9P2E8 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MARCH4Q9P2E8 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MARCH4Q9P2E8 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MARCH4Q9P2E8 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MARCH4Q9P2E8 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MARCH4Q9P2E8 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MARCH4Q9P2E8 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MARCH4Q9P2E8 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MARCH4Q9P2E8 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MARCH4Q9P2E8 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MARCH4Q9P2E8 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MARCH4Q9P2E8 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MARCH4Q9P2E8 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MARCH4Q9P2E8 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MARCH4Q9P2E8 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MARCH4Q9P2E8 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MARCH4Q9P2E8 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MARCH4Q9P2E8 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
MARCH4Q9P2E8 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MARCH4Q9P2E8 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MARCH4Q9P2E8 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MARCH4Q9P2E8 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MARCH4Q9P2E8 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MARCH4Q9P2E8 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MARCH4Q9P2E8 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MARCH4Q9P2E8 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MARCH4Q9P2E8 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MARCH4Q9P2E8 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MARCH4Q9P2E8 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MARCH4Q9P2E8 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MARCH4Q9P2E8 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MARCH4Q9P2E8 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MARCH4Q9P2E8 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MARCH4Q9P2E8 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
MARCH4Q9P2E8 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
MARCH4Q9P2E8 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MARCH4Q9P2E8 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MARCH4Q9P2E8 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MARCH4Q9P2E8 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MARCH4Q9P2E8 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MARCH4Q9P2E8 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MARCH4Q9P2E8 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MARCH4Q9P2E8 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MARCH4Q9P2E8 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MARCH4Q9P2E8 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MARCH4Q9P2E8 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MARCH4Q9P2E8 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MARCH4Q9P2E8 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MARCH4Q9P2E8 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MARCH4Q9P2E8 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MARCH4Q9P2E8 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MARCH4Q9P2E8 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
MARCH4Q9P2E8 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MARCH4Q9P2E8 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MARCH4Q9P2E8 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MARCH4Q9P2E8 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MARCH4Q9P2E8 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MARCH4Q9P2E8 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MARCH4Q9P2E8 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MARCH4Q9P2E8 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MARCH4Q9P2E8 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
MARCH4Q9P2E8 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MARCH4Q9P2E8 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MARCH4Q9P2E8 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MARCH4Q9P2E8 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MARCH4Q9P2E8 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MARCH4Q9P2E8 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MARCH4Q9P2E8 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MARCH4Q9P2E8 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MARCH4Q9P2E8 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.7 ms