Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2D1

CHD7, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 2,997 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD7Q9P2D1 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CHD7Q9P2D1 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHD7Q9P2D1 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHD7Q9P2D1 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHD7Q9P2D1 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHD7Q9P2D1 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CHD7Q9P2D1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHD7Q9P2D1 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHD7Q9P2D1 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHD7Q9P2D1 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHD7Q9P2D1 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHD7Q9P2D1 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHD7Q9P2D1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHD7Q9P2D1 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHD7Q9P2D1 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHD7Q9P2D1 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHD7Q9P2D1 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHD7Q9P2D1 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHD7Q9P2D1 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHD7Q9P2D1 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHD7Q9P2D1 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHD7Q9P2D1 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHD7Q9P2D1 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHD7Q9P2D1 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHD7Q9P2D1 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHD7Q9P2D1 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHD7Q9P2D1 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHD7Q9P2D1 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHD7Q9P2D1 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHD7Q9P2D1 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHD7Q9P2D1 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHD7Q9P2D1 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHD7Q9P2D1 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHD7Q9P2D1 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHD7Q9P2D1 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHD7Q9P2D1 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHD7Q9P2D1 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHD7Q9P2D1 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHD7Q9P2D1 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHD7Q9P2D1 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHD7Q9P2D1 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHD7Q9P2D1 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHD7Q9P2D1 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CHD7Q9P2D1 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHD7Q9P2D1 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHD7Q9P2D1 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHD7Q9P2D1 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHD7Q9P2D1 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHD7Q9P2D1 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CHD7Q9P2D1 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHD7Q9P2D1 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHD7Q9P2D1 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHD7Q9P2D1 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHD7Q9P2D1 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHD7Q9P2D1 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHD7Q9P2D1 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHD7Q9P2D1 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHD7Q9P2D1 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHD7Q9P2D1 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHD7Q9P2D1 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHD7Q9P2D1 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHD7Q9P2D1 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHD7Q9P2D1 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CHD7Q9P2D1 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHD7Q9P2D1 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHD7Q9P2D1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHD7Q9P2D1 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHD7Q9P2D1 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHD7Q9P2D1 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHD7Q9P2D1 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHD7Q9P2D1 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CHD7Q9P2D1 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHD7Q9P2D1 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHD7Q9P2D1 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHD7Q9P2D1 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHD7Q9P2D1 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHD7Q9P2D1 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHD7Q9P2D1 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHD7Q9P2D1 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHD7Q9P2D1 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CHD7Q9P2D1 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CHD7Q9P2D1 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CHD7Q9P2D1 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CHD7Q9P2D1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CHD7Q9P2D1 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CHD7Q9P2D1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHD7Q9P2D1 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHD7Q9P2D1 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHD7Q9P2D1 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHD7Q9P2D1 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHD7Q9P2D1 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHD7Q9P2D1 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CHD7Q9P2D1 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CHD7Q9P2D1 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CHD7Q9P2D1 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHD7Q9P2D1 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHD7Q9P2D1 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHD7Q9P2D1 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHD7Q9P2D1 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHD7Q9P2D1 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms