Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2B4

CTTNBP2NL, CTTNBP2 N-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNBP2NLQ9P2B4 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTTNBP2NLQ9P2B4 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTTNBP2NLQ9P2B4 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTTNBP2NLQ9P2B4 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTTNBP2NLQ9P2B4 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CTTNBP2NLQ9P2B4 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CTTNBP2NLQ9P2B4 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CTTNBP2NLQ9P2B4 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CTTNBP2NLQ9P2B4 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CTTNBP2NLQ9P2B4 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CTTNBP2NLQ9P2B4 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CTTNBP2NLQ9P2B4 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CTTNBP2NLQ9P2B4 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTTNBP2NLQ9P2B4 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTTNBP2NLQ9P2B4 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTTNBP2NLQ9P2B4 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTTNBP2NLQ9P2B4 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTTNBP2NLQ9P2B4 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTTNBP2NLQ9P2B4 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTTNBP2NLQ9P2B4 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CTTNBP2NLQ9P2B4 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTTNBP2NLQ9P2B4 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTTNBP2NLQ9P2B4 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTTNBP2NLQ9P2B4 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTTNBP2NLQ9P2B4 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTTNBP2NLQ9P2B4 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CTTNBP2NLQ9P2B4 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTTNBP2NLQ9P2B4 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTTNBP2NLQ9P2B4 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTTNBP2NLQ9P2B4 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTTNBP2NLQ9P2B4 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTTNBP2NLQ9P2B4 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CTTNBP2NLQ9P2B4 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTTNBP2NLQ9P2B4 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CTTNBP2NLQ9P2B4 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTTNBP2NLQ9P2B4 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTTNBP2NLQ9P2B4 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTTNBP2NLQ9P2B4 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTTNBP2NLQ9P2B4 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTTNBP2NLQ9P2B4 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTTNBP2NLQ9P2B4 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTTNBP2NLQ9P2B4 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTTNBP2NLQ9P2B4 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTTNBP2NLQ9P2B4 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTTNBP2NLQ9P2B4 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTTNBP2NLQ9P2B4 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTTNBP2NLQ9P2B4 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTTNBP2NLQ9P2B4 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTTNBP2NLQ9P2B4 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CTTNBP2NLQ9P2B4 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTTNBP2NLQ9P2B4 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTTNBP2NLQ9P2B4 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CTTNBP2NLQ9P2B4 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTTNBP2NLQ9P2B4 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTTNBP2NLQ9P2B4 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTTNBP2NLQ9P2B4 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTTNBP2NLQ9P2B4 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTTNBP2NLQ9P2B4 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTTNBP2NLQ9P2B4 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTTNBP2NLQ9P2B4 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTTNBP2NLQ9P2B4 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTTNBP2NLQ9P2B4 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTTNBP2NLQ9P2B4 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTTNBP2NLQ9P2B4 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTTNBP2NLQ9P2B4 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTTNBP2NLQ9P2B4 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTTNBP2NLQ9P2B4 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTTNBP2NLQ9P2B4 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CTTNBP2NLQ9P2B4 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CTTNBP2NLQ9P2B4 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTTNBP2NLQ9P2B4 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTTNBP2NLQ9P2B4 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTTNBP2NLQ9P2B4 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CTTNBP2NLQ9P2B4 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTTNBP2NLQ9P2B4 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTTNBP2NLQ9P2B4 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTTNBP2NLQ9P2B4 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTTNBP2NLQ9P2B4 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTTNBP2NLQ9P2B4 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTTNBP2NLQ9P2B4 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTTNBP2NLQ9P2B4 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTTNBP2NLQ9P2B4 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTTNBP2NLQ9P2B4 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTTNBP2NLQ9P2B4 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CTTNBP2NLQ9P2B4 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTTNBP2NLQ9P2B4 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTTNBP2NLQ9P2B4 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTTNBP2NLQ9P2B4 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTTNBP2NLQ9P2B4 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTTNBP2NLQ9P2B4 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTTNBP2NLQ9P2B4 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTTNBP2NLQ9P2B4 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.7 ms