Protein–RNA interactions for Protein: Q9P218

COL20A1, Collagen alpha-1(XX) chain, humanhuman

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Length 1,284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL20A1Q9P218 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
COL20A1Q9P218 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
COL20A1Q9P218 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
COL20A1Q9P218 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
COL20A1Q9P218 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
COL20A1Q9P218 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
COL20A1Q9P218 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
COL20A1Q9P218 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
COL20A1Q9P218 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
COL20A1Q9P218 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
COL20A1Q9P218 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
COL20A1Q9P218 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
COL20A1Q9P218 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
COL20A1Q9P218 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
COL20A1Q9P218 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
COL20A1Q9P218 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
COL20A1Q9P218 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
COL20A1Q9P218 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
COL20A1Q9P218 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC26■■□□□ 1.75
COL20A1Q9P218 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
COL20A1Q9P218 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
COL20A1Q9P218 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
COL20A1Q9P218 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
COL20A1Q9P218 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
COL20A1Q9P218 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
COL20A1Q9P218 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
COL20A1Q9P218 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
COL20A1Q9P218 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
COL20A1Q9P218 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
COL20A1Q9P218 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
COL20A1Q9P218 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
COL20A1Q9P218 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
COL20A1Q9P218 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
COL20A1Q9P218 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
COL20A1Q9P218 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
COL20A1Q9P218 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
COL20A1Q9P218 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
COL20A1Q9P218 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
COL20A1Q9P218 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
COL20A1Q9P218 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
COL20A1Q9P218 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
COL20A1Q9P218 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
COL20A1Q9P218 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
COL20A1Q9P218 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
COL20A1Q9P218 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
COL20A1Q9P218 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
COL20A1Q9P218 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
COL20A1Q9P218 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
COL20A1Q9P218 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
COL20A1Q9P218 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
COL20A1Q9P218 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
COL20A1Q9P218 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
COL20A1Q9P218 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
COL20A1Q9P218 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
COL20A1Q9P218 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
COL20A1Q9P218 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
COL20A1Q9P218 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
COL20A1Q9P218 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
COL20A1Q9P218 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
COL20A1Q9P218 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
COL20A1Q9P218 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
COL20A1Q9P218 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
COL20A1Q9P218 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
COL20A1Q9P218 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
COL20A1Q9P218 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
COL20A1Q9P218 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
COL20A1Q9P218 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
COL20A1Q9P218 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
COL20A1Q9P218 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
COL20A1Q9P218 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
COL20A1Q9P218 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
COL20A1Q9P218 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
COL20A1Q9P218 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
COL20A1Q9P218 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
COL20A1Q9P218 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
COL20A1Q9P218 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
COL20A1Q9P218 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
COL20A1Q9P218 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
COL20A1Q9P218 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
COL20A1Q9P218 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
COL20A1Q9P218 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
COL20A1Q9P218 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
COL20A1Q9P218 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
COL20A1Q9P218 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
COL20A1Q9P218 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
COL20A1Q9P218 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
COL20A1Q9P218 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
COL20A1Q9P218 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
COL20A1Q9P218 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
COL20A1Q9P218 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
COL20A1Q9P218 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
COL20A1Q9P218 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
COL20A1Q9P218 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
COL20A1Q9P218 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
COL20A1Q9P218 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
COL20A1Q9P218 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
COL20A1Q9P218 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
COL20A1Q9P218 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
COL20A1Q9P218 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
COL20A1Q9P218 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
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