Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0U3

SENP1, Sentrin-specific protease 1, humanhuman

Predictions only

Length 644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP1Q9P0U3 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SENP1Q9P0U3 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SENP1Q9P0U3 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SENP1Q9P0U3 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SENP1Q9P0U3 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SENP1Q9P0U3 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SENP1Q9P0U3 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SENP1Q9P0U3 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SENP1Q9P0U3 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SENP1Q9P0U3 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SENP1Q9P0U3 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SENP1Q9P0U3 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SENP1Q9P0U3 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SENP1Q9P0U3 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SENP1Q9P0U3 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SENP1Q9P0U3 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SENP1Q9P0U3 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SENP1Q9P0U3 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SENP1Q9P0U3 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SENP1Q9P0U3 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SENP1Q9P0U3 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SENP1Q9P0U3 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SENP1Q9P0U3 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SENP1Q9P0U3 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SENP1Q9P0U3 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SENP1Q9P0U3 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SENP1Q9P0U3 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SENP1Q9P0U3 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SENP1Q9P0U3 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SENP1Q9P0U3 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SENP1Q9P0U3 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SENP1Q9P0U3 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SENP1Q9P0U3 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SENP1Q9P0U3 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SENP1Q9P0U3 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SENP1Q9P0U3 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SENP1Q9P0U3 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SENP1Q9P0U3 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SENP1Q9P0U3 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SENP1Q9P0U3 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SENP1Q9P0U3 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SENP1Q9P0U3 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SENP1Q9P0U3 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SENP1Q9P0U3 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SENP1Q9P0U3 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SENP1Q9P0U3 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SENP1Q9P0U3 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SENP1Q9P0U3 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SENP1Q9P0U3 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SENP1Q9P0U3 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SENP1Q9P0U3 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SENP1Q9P0U3 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SENP1Q9P0U3 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SENP1Q9P0U3 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SENP1Q9P0U3 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SENP1Q9P0U3 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SENP1Q9P0U3 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SENP1Q9P0U3 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SENP1Q9P0U3 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SENP1Q9P0U3 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SENP1Q9P0U3 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SENP1Q9P0U3 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SENP1Q9P0U3 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SENP1Q9P0U3 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SENP1Q9P0U3 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SENP1Q9P0U3 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SENP1Q9P0U3 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SENP1Q9P0U3 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SENP1Q9P0U3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SENP1Q9P0U3 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SENP1Q9P0U3 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SENP1Q9P0U3 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SENP1Q9P0U3 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SENP1Q9P0U3 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SENP1Q9P0U3 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SENP1Q9P0U3 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SENP1Q9P0U3 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SENP1Q9P0U3 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SENP1Q9P0U3 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SENP1Q9P0U3 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SENP1Q9P0U3 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SENP1Q9P0U3 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SENP1Q9P0U3 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SENP1Q9P0U3 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SENP1Q9P0U3 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SENP1Q9P0U3 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SENP1Q9P0U3 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SENP1Q9P0U3 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SENP1Q9P0U3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SENP1Q9P0U3 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SENP1Q9P0U3 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SENP1Q9P0U3 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SENP1Q9P0U3 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SENP1Q9P0U3 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SENP1Q9P0U3 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SENP1Q9P0U3 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SENP1Q9P0U3 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SENP1Q9P0U3 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SENP1Q9P0U3 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SENP1Q9P0U3 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms