Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L0

VAPA, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPAQ9P0L0 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VAPAQ9P0L0 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
VAPAQ9P0L0 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VAPAQ9P0L0 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
VAPAQ9P0L0 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VAPAQ9P0L0 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
VAPAQ9P0L0 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
VAPAQ9P0L0 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VAPAQ9P0L0 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VAPAQ9P0L0 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
VAPAQ9P0L0 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VAPAQ9P0L0 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VAPAQ9P0L0 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
VAPAQ9P0L0 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
VAPAQ9P0L0 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VAPAQ9P0L0 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
VAPAQ9P0L0 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
VAPAQ9P0L0 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VAPAQ9P0L0 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
VAPAQ9P0L0 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VAPAQ9P0L0 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
VAPAQ9P0L0 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VAPAQ9P0L0 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VAPAQ9P0L0 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
VAPAQ9P0L0 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VAPAQ9P0L0 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VAPAQ9P0L0 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VAPAQ9P0L0 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VAPAQ9P0L0 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VAPAQ9P0L0 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
VAPAQ9P0L0 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VAPAQ9P0L0 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VAPAQ9P0L0 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VAPAQ9P0L0 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VAPAQ9P0L0 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VAPAQ9P0L0 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VAPAQ9P0L0 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
VAPAQ9P0L0 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
VAPAQ9P0L0 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
VAPAQ9P0L0 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VAPAQ9P0L0 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VAPAQ9P0L0 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
VAPAQ9P0L0 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VAPAQ9P0L0 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VAPAQ9P0L0 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
VAPAQ9P0L0 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
VAPAQ9P0L0 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VAPAQ9P0L0 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
VAPAQ9P0L0 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VAPAQ9P0L0 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VAPAQ9P0L0 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
VAPAQ9P0L0 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
VAPAQ9P0L0 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
VAPAQ9P0L0 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
VAPAQ9P0L0 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
VAPAQ9P0L0 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VAPAQ9P0L0 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VAPAQ9P0L0 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
VAPAQ9P0L0 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VAPAQ9P0L0 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VAPAQ9P0L0 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
VAPAQ9P0L0 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
VAPAQ9P0L0 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
VAPAQ9P0L0 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VAPAQ9P0L0 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VAPAQ9P0L0 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VAPAQ9P0L0 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VAPAQ9P0L0 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VAPAQ9P0L0 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VAPAQ9P0L0 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VAPAQ9P0L0 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VAPAQ9P0L0 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VAPAQ9P0L0 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VAPAQ9P0L0 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VAPAQ9P0L0 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VAPAQ9P0L0 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VAPAQ9P0L0 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VAPAQ9P0L0 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VAPAQ9P0L0 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VAPAQ9P0L0 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
VAPAQ9P0L0 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VAPAQ9P0L0 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VAPAQ9P0L0 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VAPAQ9P0L0 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VAPAQ9P0L0 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VAPAQ9P0L0 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VAPAQ9P0L0 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VAPAQ9P0L0 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VAPAQ9P0L0 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VAPAQ9P0L0 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
VAPAQ9P0L0 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VAPAQ9P0L0 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VAPAQ9P0L0 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VAPAQ9P0L0 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VAPAQ9P0L0 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VAPAQ9P0L0 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VAPAQ9P0L0 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VAPAQ9P0L0 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VAPAQ9P0L0 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VAPAQ9P0L0 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms