Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZZ3

CHMP5, Charged multivesicular body protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP5Q9NZZ3 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CHMP5Q9NZZ3 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CHMP5Q9NZZ3 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CHMP5Q9NZZ3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CHMP5Q9NZZ3 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CHMP5Q9NZZ3 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CHMP5Q9NZZ3 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CHMP5Q9NZZ3 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CHMP5Q9NZZ3 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CHMP5Q9NZZ3 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CHMP5Q9NZZ3 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CHMP5Q9NZZ3 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CHMP5Q9NZZ3 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CHMP5Q9NZZ3 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
CHMP5Q9NZZ3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CHMP5Q9NZZ3 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CHMP5Q9NZZ3 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CHMP5Q9NZZ3 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CHMP5Q9NZZ3 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CHMP5Q9NZZ3 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
CHMP5Q9NZZ3 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CHMP5Q9NZZ3 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CHMP5Q9NZZ3 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CHMP5Q9NZZ3 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CHMP5Q9NZZ3 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CHMP5Q9NZZ3 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CHMP5Q9NZZ3 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CHMP5Q9NZZ3 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CHMP5Q9NZZ3 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CHMP5Q9NZZ3 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CHMP5Q9NZZ3 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CHMP5Q9NZZ3 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
CHMP5Q9NZZ3 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
CHMP5Q9NZZ3 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CHMP5Q9NZZ3 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CHMP5Q9NZZ3 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
CHMP5Q9NZZ3 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CHMP5Q9NZZ3 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CHMP5Q9NZZ3 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CHMP5Q9NZZ3 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CHMP5Q9NZZ3 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CHMP5Q9NZZ3 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CHMP5Q9NZZ3 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CHMP5Q9NZZ3 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CHMP5Q9NZZ3 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CHMP5Q9NZZ3 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CHMP5Q9NZZ3 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
CHMP5Q9NZZ3 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CHMP5Q9NZZ3 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CHMP5Q9NZZ3 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.88
CHMP5Q9NZZ3 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.88
CHMP5Q9NZZ3 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CHMP5Q9NZZ3 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CHMP5Q9NZZ3 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CHMP5Q9NZZ3 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CHMP5Q9NZZ3 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CHMP5Q9NZZ3 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CHMP5Q9NZZ3 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CHMP5Q9NZZ3 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CHMP5Q9NZZ3 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CHMP5Q9NZZ3 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CHMP5Q9NZZ3 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CHMP5Q9NZZ3 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
CHMP5Q9NZZ3 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CHMP5Q9NZZ3 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CHMP5Q9NZZ3 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CHMP5Q9NZZ3 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CHMP5Q9NZZ3 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CHMP5Q9NZZ3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CHMP5Q9NZZ3 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CHMP5Q9NZZ3 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CHMP5Q9NZZ3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CHMP5Q9NZZ3 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CHMP5Q9NZZ3 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CHMP5Q9NZZ3 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CHMP5Q9NZZ3 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CHMP5Q9NZZ3 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CHMP5Q9NZZ3 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CHMP5Q9NZZ3 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CHMP5Q9NZZ3 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CHMP5Q9NZZ3 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CHMP5Q9NZZ3 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CHMP5Q9NZZ3 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CHMP5Q9NZZ3 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CHMP5Q9NZZ3 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CHMP5Q9NZZ3 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CHMP5Q9NZZ3 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CHMP5Q9NZZ3 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CHMP5Q9NZZ3 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CHMP5Q9NZZ3 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CHMP5Q9NZZ3 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CHMP5Q9NZZ3 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CHMP5Q9NZZ3 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CHMP5Q9NZZ3 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CHMP5Q9NZZ3 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CHMP5Q9NZZ3 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CHMP5Q9NZZ3 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CHMP5Q9NZZ3 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CHMP5Q9NZZ3 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CHMP5Q9NZZ3 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms