Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYG8

KCNK4, Potassium channel subfamily K member 4, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNK4Q9NYG8 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KCNK4Q9NYG8 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KCNK4Q9NYG8 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KCNK4Q9NYG8 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KCNK4Q9NYG8 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KCNK4Q9NYG8 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KCNK4Q9NYG8 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KCNK4Q9NYG8 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KCNK4Q9NYG8 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KCNK4Q9NYG8 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KCNK4Q9NYG8 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KCNK4Q9NYG8 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KCNK4Q9NYG8 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KCNK4Q9NYG8 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KCNK4Q9NYG8 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KCNK4Q9NYG8 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KCNK4Q9NYG8 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
KCNK4Q9NYG8 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
KCNK4Q9NYG8 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KCNK4Q9NYG8 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
KCNK4Q9NYG8 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KCNK4Q9NYG8 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KCNK4Q9NYG8 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KCNK4Q9NYG8 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KCNK4Q9NYG8 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KCNK4Q9NYG8 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KCNK4Q9NYG8 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KCNK4Q9NYG8 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KCNK4Q9NYG8 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KCNK4Q9NYG8 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KCNK4Q9NYG8 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KCNK4Q9NYG8 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KCNK4Q9NYG8 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KCNK4Q9NYG8 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KCNK4Q9NYG8 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KCNK4Q9NYG8 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KCNK4Q9NYG8 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KCNK4Q9NYG8 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KCNK4Q9NYG8 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KCNK4Q9NYG8 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KCNK4Q9NYG8 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KCNK4Q9NYG8 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KCNK4Q9NYG8 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KCNK4Q9NYG8 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KCNK4Q9NYG8 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
KCNK4Q9NYG8 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
KCNK4Q9NYG8 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KCNK4Q9NYG8 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KCNK4Q9NYG8 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KCNK4Q9NYG8 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KCNK4Q9NYG8 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KCNK4Q9NYG8 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KCNK4Q9NYG8 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KCNK4Q9NYG8 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KCNK4Q9NYG8 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KCNK4Q9NYG8 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KCNK4Q9NYG8 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KCNK4Q9NYG8 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KCNK4Q9NYG8 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KCNK4Q9NYG8 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KCNK4Q9NYG8 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KCNK4Q9NYG8 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KCNK4Q9NYG8 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
KCNK4Q9NYG8 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KCNK4Q9NYG8 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KCNK4Q9NYG8 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KCNK4Q9NYG8 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
KCNK4Q9NYG8 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KCNK4Q9NYG8 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KCNK4Q9NYG8 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KCNK4Q9NYG8 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KCNK4Q9NYG8 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KCNK4Q9NYG8 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KCNK4Q9NYG8 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KCNK4Q9NYG8 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KCNK4Q9NYG8 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KCNK4Q9NYG8 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
KCNK4Q9NYG8 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KCNK4Q9NYG8 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KCNK4Q9NYG8 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KCNK4Q9NYG8 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KCNK4Q9NYG8 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KCNK4Q9NYG8 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KCNK4Q9NYG8 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KCNK4Q9NYG8 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KCNK4Q9NYG8 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KCNK4Q9NYG8 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KCNK4Q9NYG8 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KCNK4Q9NYG8 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KCNK4Q9NYG8 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
KCNK4Q9NYG8 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
KCNK4Q9NYG8 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
KCNK4Q9NYG8 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KCNK4Q9NYG8 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KCNK4Q9NYG8 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KCNK4Q9NYG8 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KCNK4Q9NYG8 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KCNK4Q9NYG8 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KCNK4Q9NYG8 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
KCNK4Q9NYG8 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms