Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYF3

FAM53C, Protein FAM53C, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53CQ9NYF3 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FAM53CQ9NYF3 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FAM53CQ9NYF3 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FAM53CQ9NYF3 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FAM53CQ9NYF3 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FAM53CQ9NYF3 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FAM53CQ9NYF3 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
FAM53CQ9NYF3 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FAM53CQ9NYF3 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FAM53CQ9NYF3 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FAM53CQ9NYF3 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FAM53CQ9NYF3 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FAM53CQ9NYF3 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FAM53CQ9NYF3 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FAM53CQ9NYF3 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FAM53CQ9NYF3 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FAM53CQ9NYF3 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FAM53CQ9NYF3 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FAM53CQ9NYF3 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FAM53CQ9NYF3 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FAM53CQ9NYF3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FAM53CQ9NYF3 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FAM53CQ9NYF3 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FAM53CQ9NYF3 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FAM53CQ9NYF3 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
FAM53CQ9NYF3 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FAM53CQ9NYF3 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FAM53CQ9NYF3 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FAM53CQ9NYF3 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FAM53CQ9NYF3 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FAM53CQ9NYF3 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FAM53CQ9NYF3 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FAM53CQ9NYF3 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FAM53CQ9NYF3 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FAM53CQ9NYF3 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FAM53CQ9NYF3 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FAM53CQ9NYF3 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FAM53CQ9NYF3 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FAM53CQ9NYF3 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FAM53CQ9NYF3 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FAM53CQ9NYF3 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FAM53CQ9NYF3 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
FAM53CQ9NYF3 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FAM53CQ9NYF3 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FAM53CQ9NYF3 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FAM53CQ9NYF3 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FAM53CQ9NYF3 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FAM53CQ9NYF3 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FAM53CQ9NYF3 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FAM53CQ9NYF3 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FAM53CQ9NYF3 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FAM53CQ9NYF3 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FAM53CQ9NYF3 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FAM53CQ9NYF3 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FAM53CQ9NYF3 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FAM53CQ9NYF3 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FAM53CQ9NYF3 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FAM53CQ9NYF3 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FAM53CQ9NYF3 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FAM53CQ9NYF3 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FAM53CQ9NYF3 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FAM53CQ9NYF3 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FAM53CQ9NYF3 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FAM53CQ9NYF3 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FAM53CQ9NYF3 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FAM53CQ9NYF3 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FAM53CQ9NYF3 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FAM53CQ9NYF3 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FAM53CQ9NYF3 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FAM53CQ9NYF3 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FAM53CQ9NYF3 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FAM53CQ9NYF3 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FAM53CQ9NYF3 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FAM53CQ9NYF3 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FAM53CQ9NYF3 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FAM53CQ9NYF3 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
FAM53CQ9NYF3 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FAM53CQ9NYF3 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FAM53CQ9NYF3 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM53CQ9NYF3 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM53CQ9NYF3 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM53CQ9NYF3 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM53CQ9NYF3 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM53CQ9NYF3 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM53CQ9NYF3 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM53CQ9NYF3 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM53CQ9NYF3 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM53CQ9NYF3 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM53CQ9NYF3 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM53CQ9NYF3 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM53CQ9NYF3 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM53CQ9NYF3 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM53CQ9NYF3 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM53CQ9NYF3 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FAM53CQ9NYF3 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FAM53CQ9NYF3 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FAM53CQ9NYF3 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FAM53CQ9NYF3 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FAM53CQ9NYF3 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FAM53CQ9NYF3 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms