Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY59

SMPD3, Sphingomyelin phosphodiesterase 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPD3Q9NY59 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMPD3Q9NY59 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMPD3Q9NY59 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMPD3Q9NY59 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMPD3Q9NY59 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SMPD3Q9NY59 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMPD3Q9NY59 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMPD3Q9NY59 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMPD3Q9NY59 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMPD3Q9NY59 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMPD3Q9NY59 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMPD3Q9NY59 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMPD3Q9NY59 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMPD3Q9NY59 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMPD3Q9NY59 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMPD3Q9NY59 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMPD3Q9NY59 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMPD3Q9NY59 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SMPD3Q9NY59 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SMPD3Q9NY59 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SMPD3Q9NY59 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SMPD3Q9NY59 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMPD3Q9NY59 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMPD3Q9NY59 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMPD3Q9NY59 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMPD3Q9NY59 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMPD3Q9NY59 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SMPD3Q9NY59 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SMPD3Q9NY59 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SMPD3Q9NY59 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SMPD3Q9NY59 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SMPD3Q9NY59 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMPD3Q9NY59 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMPD3Q9NY59 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMPD3Q9NY59 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMPD3Q9NY59 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMPD3Q9NY59 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMPD3Q9NY59 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMPD3Q9NY59 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SMPD3Q9NY59 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMPD3Q9NY59 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMPD3Q9NY59 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMPD3Q9NY59 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMPD3Q9NY59 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMPD3Q9NY59 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMPD3Q9NY59 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMPD3Q9NY59 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMPD3Q9NY59 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMPD3Q9NY59 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMPD3Q9NY59 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMPD3Q9NY59 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMPD3Q9NY59 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMPD3Q9NY59 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMPD3Q9NY59 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMPD3Q9NY59 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMPD3Q9NY59 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMPD3Q9NY59 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMPD3Q9NY59 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMPD3Q9NY59 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMPD3Q9NY59 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMPD3Q9NY59 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMPD3Q9NY59 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMPD3Q9NY59 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMPD3Q9NY59 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SMPD3Q9NY59 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SMPD3Q9NY59 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SMPD3Q9NY59 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SMPD3Q9NY59 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SMPD3Q9NY59 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SMPD3Q9NY59 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SMPD3Q9NY59 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SMPD3Q9NY59 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SMPD3Q9NY59 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SMPD3Q9NY59 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SMPD3Q9NY59 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SMPD3Q9NY59 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SMPD3Q9NY59 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SMPD3Q9NY59 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SMPD3Q9NY59 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SMPD3Q9NY59 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SMPD3Q9NY59 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SMPD3Q9NY59 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SMPD3Q9NY59 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SMPD3Q9NY59 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
SMPD3Q9NY59 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SMPD3Q9NY59 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SMPD3Q9NY59 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SMPD3Q9NY59 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
SMPD3Q9NY59 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SMPD3Q9NY59 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SMPD3Q9NY59 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SMPD3Q9NY59 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SMPD3Q9NY59 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SMPD3Q9NY59 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SMPD3Q9NY59 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SMPD3Q9NY59 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SMPD3Q9NY59 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
SMPD3Q9NY59 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SMPD3Q9NY59 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SMPD3Q9NY59 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90 ms