Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXX6

NSMCE4A, Non-structural maintenance of chromosomes element 4 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE4AQ9NXX6 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NSMCE4AQ9NXX6 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NSMCE4AQ9NXX6 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NSMCE4AQ9NXX6 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NSMCE4AQ9NXX6 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NSMCE4AQ9NXX6 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NSMCE4AQ9NXX6 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NSMCE4AQ9NXX6 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NSMCE4AQ9NXX6 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NSMCE4AQ9NXX6 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NSMCE4AQ9NXX6 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NSMCE4AQ9NXX6 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NSMCE4AQ9NXX6 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NSMCE4AQ9NXX6 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NSMCE4AQ9NXX6 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NSMCE4AQ9NXX6 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NSMCE4AQ9NXX6 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NSMCE4AQ9NXX6 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NSMCE4AQ9NXX6 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NSMCE4AQ9NXX6 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NSMCE4AQ9NXX6 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NSMCE4AQ9NXX6 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NSMCE4AQ9NXX6 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NSMCE4AQ9NXX6 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NSMCE4AQ9NXX6 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NSMCE4AQ9NXX6 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NSMCE4AQ9NXX6 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NSMCE4AQ9NXX6 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NSMCE4AQ9NXX6 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NSMCE4AQ9NXX6 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NSMCE4AQ9NXX6 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NSMCE4AQ9NXX6 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NSMCE4AQ9NXX6 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NSMCE4AQ9NXX6 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NSMCE4AQ9NXX6 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NSMCE4AQ9NXX6 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NSMCE4AQ9NXX6 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NSMCE4AQ9NXX6 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NSMCE4AQ9NXX6 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NSMCE4AQ9NXX6 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NSMCE4AQ9NXX6 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NSMCE4AQ9NXX6 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NSMCE4AQ9NXX6 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NSMCE4AQ9NXX6 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NSMCE4AQ9NXX6 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NSMCE4AQ9NXX6 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NSMCE4AQ9NXX6 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NSMCE4AQ9NXX6 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NSMCE4AQ9NXX6 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NSMCE4AQ9NXX6 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NSMCE4AQ9NXX6 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NSMCE4AQ9NXX6 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NSMCE4AQ9NXX6 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NSMCE4AQ9NXX6 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NSMCE4AQ9NXX6 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NSMCE4AQ9NXX6 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NSMCE4AQ9NXX6 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NSMCE4AQ9NXX6 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NSMCE4AQ9NXX6 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NSMCE4AQ9NXX6 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NSMCE4AQ9NXX6 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NSMCE4AQ9NXX6 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
NSMCE4AQ9NXX6 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.23
NSMCE4AQ9NXX6 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
NSMCE4AQ9NXX6 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NSMCE4AQ9NXX6 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NSMCE4AQ9NXX6 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NSMCE4AQ9NXX6 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NSMCE4AQ9NXX6 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NSMCE4AQ9NXX6 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NSMCE4AQ9NXX6 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NSMCE4AQ9NXX6 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NSMCE4AQ9NXX6 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NSMCE4AQ9NXX6 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NSMCE4AQ9NXX6 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NSMCE4AQ9NXX6 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NSMCE4AQ9NXX6 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NSMCE4AQ9NXX6 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NSMCE4AQ9NXX6 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NSMCE4AQ9NXX6 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
NSMCE4AQ9NXX6 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NSMCE4AQ9NXX6 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NSMCE4AQ9NXX6 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NSMCE4AQ9NXX6 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NSMCE4AQ9NXX6 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NSMCE4AQ9NXX6 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NSMCE4AQ9NXX6 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NSMCE4AQ9NXX6 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NSMCE4AQ9NXX6 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NSMCE4AQ9NXX6 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NSMCE4AQ9NXX6 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NSMCE4AQ9NXX6 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NSMCE4AQ9NXX6 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NSMCE4AQ9NXX6 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NSMCE4AQ9NXX6 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NSMCE4AQ9NXX6 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NSMCE4AQ9NXX6 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NSMCE4AQ9NXX6 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NSMCE4AQ9NXX6 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NSMCE4AQ9NXX6 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms