Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX36

DNAJC28, DnaJ homolog subfamily C member 28, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC28Q9NX36 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DNAJC28Q9NX36 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DNAJC28Q9NX36 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DNAJC28Q9NX36 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DNAJC28Q9NX36 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DNAJC28Q9NX36 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DNAJC28Q9NX36 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DNAJC28Q9NX36 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DNAJC28Q9NX36 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DNAJC28Q9NX36 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DNAJC28Q9NX36 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
DNAJC28Q9NX36 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DNAJC28Q9NX36 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DNAJC28Q9NX36 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DNAJC28Q9NX36 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DNAJC28Q9NX36 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DNAJC28Q9NX36 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
DNAJC28Q9NX36 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
DNAJC28Q9NX36 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
DNAJC28Q9NX36 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
DNAJC28Q9NX36 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DNAJC28Q9NX36 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DNAJC28Q9NX36 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DNAJC28Q9NX36 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DNAJC28Q9NX36 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DNAJC28Q9NX36 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DNAJC28Q9NX36 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DNAJC28Q9NX36 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DNAJC28Q9NX36 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DNAJC28Q9NX36 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DNAJC28Q9NX36 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DNAJC28Q9NX36 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DNAJC28Q9NX36 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DNAJC28Q9NX36 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DNAJC28Q9NX36 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DNAJC28Q9NX36 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DNAJC28Q9NX36 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DNAJC28Q9NX36 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DNAJC28Q9NX36 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DNAJC28Q9NX36 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DNAJC28Q9NX36 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DNAJC28Q9NX36 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DNAJC28Q9NX36 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DNAJC28Q9NX36 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DNAJC28Q9NX36 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
DNAJC28Q9NX36 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
DNAJC28Q9NX36 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DNAJC28Q9NX36 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DNAJC28Q9NX36 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DNAJC28Q9NX36 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DNAJC28Q9NX36 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
DNAJC28Q9NX36 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DNAJC28Q9NX36 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DNAJC28Q9NX36 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DNAJC28Q9NX36 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DNAJC28Q9NX36 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DNAJC28Q9NX36 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DNAJC28Q9NX36 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DNAJC28Q9NX36 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DNAJC28Q9NX36 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DNAJC28Q9NX36 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DNAJC28Q9NX36 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DNAJC28Q9NX36 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DNAJC28Q9NX36 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DNAJC28Q9NX36 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DNAJC28Q9NX36 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DNAJC28Q9NX36 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DNAJC28Q9NX36 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DNAJC28Q9NX36 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
DNAJC28Q9NX36 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DNAJC28Q9NX36 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DNAJC28Q9NX36 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DNAJC28Q9NX36 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DNAJC28Q9NX36 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DNAJC28Q9NX36 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DNAJC28Q9NX36 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DNAJC28Q9NX36 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DNAJC28Q9NX36 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DNAJC28Q9NX36 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DNAJC28Q9NX36 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DNAJC28Q9NX36 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DNAJC28Q9NX36 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DNAJC28Q9NX36 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DNAJC28Q9NX36 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DNAJC28Q9NX36 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DNAJC28Q9NX36 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DNAJC28Q9NX36 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DNAJC28Q9NX36 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DNAJC28Q9NX36 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DNAJC28Q9NX36 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DNAJC28Q9NX36 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DNAJC28Q9NX36 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DNAJC28Q9NX36 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DNAJC28Q9NX36 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DNAJC28Q9NX36 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DNAJC28Q9NX36 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
DNAJC28Q9NX36 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
DNAJC28Q9NX36 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
DNAJC28Q9NX36 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
DNAJC28Q9NX36 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms