Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVX2

NLE1, Notchless protein homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLE1Q9NVX2 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NLE1Q9NVX2 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NLE1Q9NVX2 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NLE1Q9NVX2 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NLE1Q9NVX2 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NLE1Q9NVX2 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NLE1Q9NVX2 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NLE1Q9NVX2 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NLE1Q9NVX2 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NLE1Q9NVX2 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NLE1Q9NVX2 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NLE1Q9NVX2 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NLE1Q9NVX2 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NLE1Q9NVX2 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NLE1Q9NVX2 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NLE1Q9NVX2 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NLE1Q9NVX2 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NLE1Q9NVX2 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NLE1Q9NVX2 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NLE1Q9NVX2 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NLE1Q9NVX2 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NLE1Q9NVX2 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NLE1Q9NVX2 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NLE1Q9NVX2 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NLE1Q9NVX2 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NLE1Q9NVX2 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NLE1Q9NVX2 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NLE1Q9NVX2 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NLE1Q9NVX2 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NLE1Q9NVX2 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NLE1Q9NVX2 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NLE1Q9NVX2 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NLE1Q9NVX2 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NLE1Q9NVX2 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NLE1Q9NVX2 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NLE1Q9NVX2 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NLE1Q9NVX2 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NLE1Q9NVX2 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NLE1Q9NVX2 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NLE1Q9NVX2 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NLE1Q9NVX2 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NLE1Q9NVX2 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NLE1Q9NVX2 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NLE1Q9NVX2 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NLE1Q9NVX2 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NLE1Q9NVX2 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NLE1Q9NVX2 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NLE1Q9NVX2 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NLE1Q9NVX2 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NLE1Q9NVX2 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NLE1Q9NVX2 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NLE1Q9NVX2 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NLE1Q9NVX2 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NLE1Q9NVX2 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NLE1Q9NVX2 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NLE1Q9NVX2 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NLE1Q9NVX2 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NLE1Q9NVX2 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NLE1Q9NVX2 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NLE1Q9NVX2 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NLE1Q9NVX2 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NLE1Q9NVX2 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NLE1Q9NVX2 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NLE1Q9NVX2 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NLE1Q9NVX2 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NLE1Q9NVX2 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NLE1Q9NVX2 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NLE1Q9NVX2 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NLE1Q9NVX2 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
NLE1Q9NVX2 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
NLE1Q9NVX2 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NLE1Q9NVX2 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NLE1Q9NVX2 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NLE1Q9NVX2 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NLE1Q9NVX2 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NLE1Q9NVX2 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NLE1Q9NVX2 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NLE1Q9NVX2 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NLE1Q9NVX2 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NLE1Q9NVX2 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NLE1Q9NVX2 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NLE1Q9NVX2 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NLE1Q9NVX2 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NLE1Q9NVX2 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NLE1Q9NVX2 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NLE1Q9NVX2 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NLE1Q9NVX2 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NLE1Q9NVX2 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NLE1Q9NVX2 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NLE1Q9NVX2 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NLE1Q9NVX2 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NLE1Q9NVX2 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NLE1Q9NVX2 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NLE1Q9NVX2 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NLE1Q9NVX2 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NLE1Q9NVX2 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NLE1Q9NVX2 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NLE1Q9NVX2 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NLE1Q9NVX2 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NLE1Q9NVX2 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.9 ms