Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU53

GINM1, Glycoprotein integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINM1Q9NU53 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GINM1Q9NU53 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GINM1Q9NU53 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GINM1Q9NU53 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GINM1Q9NU53 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GINM1Q9NU53 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
GINM1Q9NU53 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GINM1Q9NU53 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GINM1Q9NU53 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
GINM1Q9NU53 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
GINM1Q9NU53 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
GINM1Q9NU53 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
GINM1Q9NU53 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
GINM1Q9NU53 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GINM1Q9NU53 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
GINM1Q9NU53 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GINM1Q9NU53 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
GINM1Q9NU53 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GINM1Q9NU53 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
GINM1Q9NU53 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
GINM1Q9NU53 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GINM1Q9NU53 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GINM1Q9NU53 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GINM1Q9NU53 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GINM1Q9NU53 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GINM1Q9NU53 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GINM1Q9NU53 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GINM1Q9NU53 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GINM1Q9NU53 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GINM1Q9NU53 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GINM1Q9NU53 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GINM1Q9NU53 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GINM1Q9NU53 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
GINM1Q9NU53 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GINM1Q9NU53 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GINM1Q9NU53 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GINM1Q9NU53 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GINM1Q9NU53 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GINM1Q9NU53 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GINM1Q9NU53 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
GINM1Q9NU53 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GINM1Q9NU53 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GINM1Q9NU53 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GINM1Q9NU53 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GINM1Q9NU53 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GINM1Q9NU53 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GINM1Q9NU53 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GINM1Q9NU53 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
GINM1Q9NU53 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GINM1Q9NU53 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
GINM1Q9NU53 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
GINM1Q9NU53 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GINM1Q9NU53 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GINM1Q9NU53 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GINM1Q9NU53 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
GINM1Q9NU53 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
GINM1Q9NU53 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
GINM1Q9NU53 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GINM1Q9NU53 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
GINM1Q9NU53 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
GINM1Q9NU53 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
GINM1Q9NU53 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
GINM1Q9NU53 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
GINM1Q9NU53 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
GINM1Q9NU53 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
GINM1Q9NU53 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
GINM1Q9NU53 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
GINM1Q9NU53 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
GINM1Q9NU53 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
GINM1Q9NU53 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
GINM1Q9NU53 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
GINM1Q9NU53 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
GINM1Q9NU53 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GINM1Q9NU53 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GINM1Q9NU53 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
GINM1Q9NU53 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GINM1Q9NU53 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GINM1Q9NU53 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GINM1Q9NU53 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
GINM1Q9NU53 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC26.63■■□□□ 1.85
GINM1Q9NU53 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
GINM1Q9NU53 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC26.63■■□□□ 1.85
GINM1Q9NU53 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GINM1Q9NU53 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
GINM1Q9NU53 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GINM1Q9NU53 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GINM1Q9NU53 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GINM1Q9NU53 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
GINM1Q9NU53 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GINM1Q9NU53 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
GINM1Q9NU53 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GINM1Q9NU53 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
GINM1Q9NU53 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GINM1Q9NU53 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GINM1Q9NU53 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
GINM1Q9NU53 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GINM1Q9NU53 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GINM1Q9NU53 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GINM1Q9NU53 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
GINM1Q9NU53 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms