Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTG7

SIRT3, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-3, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT3Q9NTG7 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SIRT3Q9NTG7 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SIRT3Q9NTG7 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SIRT3Q9NTG7 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SIRT3Q9NTG7 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SIRT3Q9NTG7 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SIRT3Q9NTG7 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SIRT3Q9NTG7 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SIRT3Q9NTG7 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SIRT3Q9NTG7 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SIRT3Q9NTG7 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SIRT3Q9NTG7 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SIRT3Q9NTG7 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SIRT3Q9NTG7 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SIRT3Q9NTG7 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SIRT3Q9NTG7 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SIRT3Q9NTG7 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SIRT3Q9NTG7 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SIRT3Q9NTG7 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SIRT3Q9NTG7 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SIRT3Q9NTG7 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SIRT3Q9NTG7 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SIRT3Q9NTG7 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SIRT3Q9NTG7 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SIRT3Q9NTG7 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SIRT3Q9NTG7 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SIRT3Q9NTG7 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SIRT3Q9NTG7 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SIRT3Q9NTG7 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SIRT3Q9NTG7 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SIRT3Q9NTG7 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SIRT3Q9NTG7 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SIRT3Q9NTG7 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SIRT3Q9NTG7 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SIRT3Q9NTG7 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SIRT3Q9NTG7 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SIRT3Q9NTG7 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SIRT3Q9NTG7 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SIRT3Q9NTG7 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SIRT3Q9NTG7 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SIRT3Q9NTG7 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SIRT3Q9NTG7 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SIRT3Q9NTG7 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SIRT3Q9NTG7 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SIRT3Q9NTG7 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SIRT3Q9NTG7 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SIRT3Q9NTG7 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SIRT3Q9NTG7 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SIRT3Q9NTG7 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SIRT3Q9NTG7 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SIRT3Q9NTG7 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SIRT3Q9NTG7 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SIRT3Q9NTG7 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SIRT3Q9NTG7 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SIRT3Q9NTG7 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SIRT3Q9NTG7 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SIRT3Q9NTG7 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SIRT3Q9NTG7 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SIRT3Q9NTG7 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SIRT3Q9NTG7 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SIRT3Q9NTG7 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SIRT3Q9NTG7 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SIRT3Q9NTG7 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SIRT3Q9NTG7 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SIRT3Q9NTG7 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SIRT3Q9NTG7 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SIRT3Q9NTG7 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SIRT3Q9NTG7 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SIRT3Q9NTG7 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SIRT3Q9NTG7 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SIRT3Q9NTG7 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SIRT3Q9NTG7 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SIRT3Q9NTG7 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SIRT3Q9NTG7 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SIRT3Q9NTG7 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SIRT3Q9NTG7 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SIRT3Q9NTG7 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SIRT3Q9NTG7 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SIRT3Q9NTG7 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SIRT3Q9NTG7 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SIRT3Q9NTG7 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SIRT3Q9NTG7 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
SIRT3Q9NTG7 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SIRT3Q9NTG7 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SIRT3Q9NTG7 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SIRT3Q9NTG7 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SIRT3Q9NTG7 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SIRT3Q9NTG7 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SIRT3Q9NTG7 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SIRT3Q9NTG7 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SIRT3Q9NTG7 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SIRT3Q9NTG7 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SIRT3Q9NTG7 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SIRT3Q9NTG7 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SIRT3Q9NTG7 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SIRT3Q9NTG7 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SIRT3Q9NTG7 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SIRT3Q9NTG7 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SIRT3Q9NTG7 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SIRT3Q9NTG7 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms