Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSP4

CENPM, Centromere protein M, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPMQ9NSP4 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CENPMQ9NSP4 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CENPMQ9NSP4 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CENPMQ9NSP4 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CENPMQ9NSP4 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CENPMQ9NSP4 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CENPMQ9NSP4 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CENPMQ9NSP4 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CENPMQ9NSP4 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CENPMQ9NSP4 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CENPMQ9NSP4 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CENPMQ9NSP4 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CENPMQ9NSP4 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CENPMQ9NSP4 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CENPMQ9NSP4 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CENPMQ9NSP4 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CENPMQ9NSP4 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CENPMQ9NSP4 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CENPMQ9NSP4 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CENPMQ9NSP4 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CENPMQ9NSP4 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CENPMQ9NSP4 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CENPMQ9NSP4 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CENPMQ9NSP4 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CENPMQ9NSP4 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CENPMQ9NSP4 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CENPMQ9NSP4 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CENPMQ9NSP4 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CENPMQ9NSP4 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CENPMQ9NSP4 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CENPMQ9NSP4 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CENPMQ9NSP4 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CENPMQ9NSP4 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CENPMQ9NSP4 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CENPMQ9NSP4 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CENPMQ9NSP4 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CENPMQ9NSP4 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CENPMQ9NSP4 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CENPMQ9NSP4 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CENPMQ9NSP4 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CENPMQ9NSP4 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CENPMQ9NSP4 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CENPMQ9NSP4 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CENPMQ9NSP4 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CENPMQ9NSP4 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CENPMQ9NSP4 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CENPMQ9NSP4 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CENPMQ9NSP4 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CENPMQ9NSP4 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CENPMQ9NSP4 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CENPMQ9NSP4 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CENPMQ9NSP4 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CENPMQ9NSP4 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CENPMQ9NSP4 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CENPMQ9NSP4 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CENPMQ9NSP4 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CENPMQ9NSP4 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CENPMQ9NSP4 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CENPMQ9NSP4 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
CENPMQ9NSP4 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CENPMQ9NSP4 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CENPMQ9NSP4 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CENPMQ9NSP4 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CENPMQ9NSP4 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CENPMQ9NSP4 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CENPMQ9NSP4 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CENPMQ9NSP4 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CENPMQ9NSP4 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CENPMQ9NSP4 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CENPMQ9NSP4 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CENPMQ9NSP4 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CENPMQ9NSP4 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CENPMQ9NSP4 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CENPMQ9NSP4 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CENPMQ9NSP4 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CENPMQ9NSP4 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CENPMQ9NSP4 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CENPMQ9NSP4 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CENPMQ9NSP4 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CENPMQ9NSP4 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CENPMQ9NSP4 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CENPMQ9NSP4 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CENPMQ9NSP4 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CENPMQ9NSP4 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CENPMQ9NSP4 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CENPMQ9NSP4 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CENPMQ9NSP4 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CENPMQ9NSP4 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CENPMQ9NSP4 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CENPMQ9NSP4 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CENPMQ9NSP4 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CENPMQ9NSP4 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CENPMQ9NSP4 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CENPMQ9NSP4 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CENPMQ9NSP4 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CENPMQ9NSP4 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CENPMQ9NSP4 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CENPMQ9NSP4 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CENPMQ9NSP4 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CENPMQ9NSP4 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms