Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB2

KRT84, Keratin, type II cuticular Hb4, humanhuman

Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT84Q9NSB2 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KRT84Q9NSB2 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KRT84Q9NSB2 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KRT84Q9NSB2 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KRT84Q9NSB2 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KRT84Q9NSB2 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KRT84Q9NSB2 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KRT84Q9NSB2 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KRT84Q9NSB2 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KRT84Q9NSB2 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KRT84Q9NSB2 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KRT84Q9NSB2 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KRT84Q9NSB2 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KRT84Q9NSB2 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
KRT84Q9NSB2 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
KRT84Q9NSB2 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KRT84Q9NSB2 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
KRT84Q9NSB2 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KRT84Q9NSB2 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
KRT84Q9NSB2 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KRT84Q9NSB2 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KRT84Q9NSB2 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KRT84Q9NSB2 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KRT84Q9NSB2 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
KRT84Q9NSB2 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KRT84Q9NSB2 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
KRT84Q9NSB2 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KRT84Q9NSB2 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KRT84Q9NSB2 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
KRT84Q9NSB2 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KRT84Q9NSB2 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KRT84Q9NSB2 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KRT84Q9NSB2 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KRT84Q9NSB2 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
KRT84Q9NSB2 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KRT84Q9NSB2 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KRT84Q9NSB2 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KRT84Q9NSB2 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KRT84Q9NSB2 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
KRT84Q9NSB2 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
KRT84Q9NSB2 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KRT84Q9NSB2 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KRT84Q9NSB2 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
KRT84Q9NSB2 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KRT84Q9NSB2 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KRT84Q9NSB2 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KRT84Q9NSB2 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KRT84Q9NSB2 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
KRT84Q9NSB2 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
KRT84Q9NSB2 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KRT84Q9NSB2 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
KRT84Q9NSB2 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
KRT84Q9NSB2 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KRT84Q9NSB2 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KRT84Q9NSB2 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KRT84Q9NSB2 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KRT84Q9NSB2 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KRT84Q9NSB2 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
KRT84Q9NSB2 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KRT84Q9NSB2 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
KRT84Q9NSB2 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
KRT84Q9NSB2 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
KRT84Q9NSB2 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
KRT84Q9NSB2 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KRT84Q9NSB2 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KRT84Q9NSB2 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
KRT84Q9NSB2 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KRT84Q9NSB2 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KRT84Q9NSB2 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
KRT84Q9NSB2 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KRT84Q9NSB2 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KRT84Q9NSB2 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KRT84Q9NSB2 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KRT84Q9NSB2 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KRT84Q9NSB2 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KRT84Q9NSB2 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KRT84Q9NSB2 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KRT84Q9NSB2 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KRT84Q9NSB2 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KRT84Q9NSB2 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KRT84Q9NSB2 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
KRT84Q9NSB2 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KRT84Q9NSB2 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KRT84Q9NSB2 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
KRT84Q9NSB2 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
KRT84Q9NSB2 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KRT84Q9NSB2 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KRT84Q9NSB2 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
KRT84Q9NSB2 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
KRT84Q9NSB2 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
KRT84Q9NSB2 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KRT84Q9NSB2 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KRT84Q9NSB2 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
KRT84Q9NSB2 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
KRT84Q9NSB2 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KRT84Q9NSB2 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KRT84Q9NSB2 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
KRT84Q9NSB2 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KRT84Q9NSB2 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KRT84Q9NSB2 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms