Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS93

TM7SF3, Transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3Q9NS93 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TM7SF3Q9NS93 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TM7SF3Q9NS93 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TM7SF3Q9NS93 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TM7SF3Q9NS93 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TM7SF3Q9NS93 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TM7SF3Q9NS93 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TM7SF3Q9NS93 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TM7SF3Q9NS93 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TM7SF3Q9NS93 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TM7SF3Q9NS93 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TM7SF3Q9NS93 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TM7SF3Q9NS93 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TM7SF3Q9NS93 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TM7SF3Q9NS93 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TM7SF3Q9NS93 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TM7SF3Q9NS93 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TM7SF3Q9NS93 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TM7SF3Q9NS93 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TM7SF3Q9NS93 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TM7SF3Q9NS93 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TM7SF3Q9NS93 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TM7SF3Q9NS93 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TM7SF3Q9NS93 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TM7SF3Q9NS93 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TM7SF3Q9NS93 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TM7SF3Q9NS93 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TM7SF3Q9NS93 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TM7SF3Q9NS93 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TM7SF3Q9NS93 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TM7SF3Q9NS93 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TM7SF3Q9NS93 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TM7SF3Q9NS93 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TM7SF3Q9NS93 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TM7SF3Q9NS93 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TM7SF3Q9NS93 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TM7SF3Q9NS93 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TM7SF3Q9NS93 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TM7SF3Q9NS93 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TM7SF3Q9NS93 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TM7SF3Q9NS93 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TM7SF3Q9NS93 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TM7SF3Q9NS93 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TM7SF3Q9NS93 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TM7SF3Q9NS93 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TM7SF3Q9NS93 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TM7SF3Q9NS93 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TM7SF3Q9NS93 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TM7SF3Q9NS93 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TM7SF3Q9NS93 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TM7SF3Q9NS93 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TM7SF3Q9NS93 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TM7SF3Q9NS93 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TM7SF3Q9NS93 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TM7SF3Q9NS93 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TM7SF3Q9NS93 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TM7SF3Q9NS93 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TM7SF3Q9NS93 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TM7SF3Q9NS93 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TM7SF3Q9NS93 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TM7SF3Q9NS93 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TM7SF3Q9NS93 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TM7SF3Q9NS93 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TM7SF3Q9NS93 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TM7SF3Q9NS93 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TM7SF3Q9NS93 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TM7SF3Q9NS93 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TM7SF3Q9NS93 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TM7SF3Q9NS93 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TM7SF3Q9NS93 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TM7SF3Q9NS93 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TM7SF3Q9NS93 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TM7SF3Q9NS93 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TM7SF3Q9NS93 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TM7SF3Q9NS93 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TM7SF3Q9NS93 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TM7SF3Q9NS93 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TM7SF3Q9NS93 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TM7SF3Q9NS93 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TM7SF3Q9NS93 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TM7SF3Q9NS93 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TM7SF3Q9NS93 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TM7SF3Q9NS93 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TM7SF3Q9NS93 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TM7SF3Q9NS93 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TM7SF3Q9NS93 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TM7SF3Q9NS93 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TM7SF3Q9NS93 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TM7SF3Q9NS93 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TM7SF3Q9NS93 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TM7SF3Q9NS93 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TM7SF3Q9NS93 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TM7SF3Q9NS93 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TM7SF3Q9NS93 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TM7SF3Q9NS93 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TM7SF3Q9NS93 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TM7SF3Q9NS93 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TM7SF3Q9NS93 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TM7SF3Q9NS93 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TM7SF3Q9NS93 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms