Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS71

GKN1, Gastrokine-1, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GKN1Q9NS71 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GKN1Q9NS71 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
GKN1Q9NS71 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GKN1Q9NS71 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GKN1Q9NS71 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GKN1Q9NS71 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GKN1Q9NS71 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GKN1Q9NS71 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GKN1Q9NS71 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GKN1Q9NS71 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GKN1Q9NS71 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GKN1Q9NS71 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GKN1Q9NS71 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GKN1Q9NS71 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
GKN1Q9NS71 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GKN1Q9NS71 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GKN1Q9NS71 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GKN1Q9NS71 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
GKN1Q9NS71 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GKN1Q9NS71 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GKN1Q9NS71 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GKN1Q9NS71 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GKN1Q9NS71 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GKN1Q9NS71 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GKN1Q9NS71 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GKN1Q9NS71 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GKN1Q9NS71 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GKN1Q9NS71 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GKN1Q9NS71 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GKN1Q9NS71 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GKN1Q9NS71 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GKN1Q9NS71 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GKN1Q9NS71 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GKN1Q9NS71 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GKN1Q9NS71 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
GKN1Q9NS71 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GKN1Q9NS71 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GKN1Q9NS71 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GKN1Q9NS71 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GKN1Q9NS71 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GKN1Q9NS71 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GKN1Q9NS71 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GKN1Q9NS71 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GKN1Q9NS71 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GKN1Q9NS71 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GKN1Q9NS71 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GKN1Q9NS71 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GKN1Q9NS71 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GKN1Q9NS71 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GKN1Q9NS71 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GKN1Q9NS71 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GKN1Q9NS71 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GKN1Q9NS71 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GKN1Q9NS71 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GKN1Q9NS71 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GKN1Q9NS71 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GKN1Q9NS71 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GKN1Q9NS71 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GKN1Q9NS71 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GKN1Q9NS71 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GKN1Q9NS71 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GKN1Q9NS71 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GKN1Q9NS71 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GKN1Q9NS71 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GKN1Q9NS71 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GKN1Q9NS71 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GKN1Q9NS71 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GKN1Q9NS71 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GKN1Q9NS71 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GKN1Q9NS71 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GKN1Q9NS71 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GKN1Q9NS71 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GKN1Q9NS71 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GKN1Q9NS71 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GKN1Q9NS71 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GKN1Q9NS71 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GKN1Q9NS71 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
GKN1Q9NS71 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GKN1Q9NS71 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GKN1Q9NS71 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GKN1Q9NS71 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GKN1Q9NS71 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GKN1Q9NS71 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GKN1Q9NS71 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
GKN1Q9NS71 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GKN1Q9NS71 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
GKN1Q9NS71 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
GKN1Q9NS71 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GKN1Q9NS71 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
GKN1Q9NS71 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GKN1Q9NS71 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GKN1Q9NS71 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GKN1Q9NS71 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GKN1Q9NS71 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GKN1Q9NS71 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GKN1Q9NS71 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GKN1Q9NS71 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GKN1Q9NS71 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GKN1Q9NS71 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GKN1Q9NS71 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms