Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS15

LTBP3, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP3Q9NS15 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC27.98■■■□□ 2.07
LTBP3Q9NS15 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
LTBP3Q9NS15 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.98■■■□□ 2.07
LTBP3Q9NS15 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
LTBP3Q9NS15 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
LTBP3Q9NS15 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
LTBP3Q9NS15 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
LTBP3Q9NS15 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LTBP3Q9NS15 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LTBP3Q9NS15 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
LTBP3Q9NS15 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
LTBP3Q9NS15 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
LTBP3Q9NS15 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LTBP3Q9NS15 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LTBP3Q9NS15 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
LTBP3Q9NS15 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LTBP3Q9NS15 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LTBP3Q9NS15 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
LTBP3Q9NS15 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
LTBP3Q9NS15 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
LTBP3Q9NS15 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LTBP3Q9NS15 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
LTBP3Q9NS15 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
LTBP3Q9NS15 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
LTBP3Q9NS15 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
LTBP3Q9NS15 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
LTBP3Q9NS15 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
LTBP3Q9NS15 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
LTBP3Q9NS15 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
LTBP3Q9NS15 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC27.94■■■□□ 2.06
LTBP3Q9NS15 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
LTBP3Q9NS15 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
LTBP3Q9NS15 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
LTBP3Q9NS15 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
LTBP3Q9NS15 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
LTBP3Q9NS15 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
LTBP3Q9NS15 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
LTBP3Q9NS15 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
LTBP3Q9NS15 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
LTBP3Q9NS15 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
LTBP3Q9NS15 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
LTBP3Q9NS15 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
LTBP3Q9NS15 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
LTBP3Q9NS15 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
LTBP3Q9NS15 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
LTBP3Q9NS15 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
LTBP3Q9NS15 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
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LTBP3Q9NS15 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC27.92■■■□□ 2.06
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LTBP3Q9NS15 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
LTBP3Q9NS15 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
LTBP3Q9NS15 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
LTBP3Q9NS15 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
LTBP3Q9NS15 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
LTBP3Q9NS15 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
LTBP3Q9NS15 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
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LTBP3Q9NS15 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
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LTBP3Q9NS15 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
LTBP3Q9NS15 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
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LTBP3Q9NS15 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
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LTBP3Q9NS15 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
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LTBP3Q9NS15 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
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LTBP3Q9NS15 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
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LTBP3Q9NS15 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
LTBP3Q9NS15 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
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LTBP3Q9NS15 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
LTBP3Q9NS15 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
LTBP3Q9NS15 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
LTBP3Q9NS15 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
LTBP3Q9NS15 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
LTBP3Q9NS15 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
LTBP3Q9NS15 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
LTBP3Q9NS15 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
LTBP3Q9NS15 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
LTBP3Q9NS15 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LTBP3Q9NS15 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
LTBP3Q9NS15 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LTBP3Q9NS15 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LTBP3Q9NS15 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
LTBP3Q9NS15 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
LTBP3Q9NS15 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
LTBP3Q9NS15 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
LTBP3Q9NS15 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
LTBP3Q9NS15 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
LTBP3Q9NS15 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
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