Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW1

RAB6B, Ras-related protein Rab-6B, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6BQ9NRW1 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB6BQ9NRW1 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB6BQ9NRW1 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB6BQ9NRW1 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB6BQ9NRW1 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB6BQ9NRW1 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB6BQ9NRW1 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB6BQ9NRW1 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB6BQ9NRW1 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB6BQ9NRW1 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB6BQ9NRW1 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB6BQ9NRW1 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB6BQ9NRW1 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB6BQ9NRW1 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB6BQ9NRW1 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAB6BQ9NRW1 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAB6BQ9NRW1 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAB6BQ9NRW1 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAB6BQ9NRW1 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAB6BQ9NRW1 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAB6BQ9NRW1 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAB6BQ9NRW1 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAB6BQ9NRW1 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAB6BQ9NRW1 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAB6BQ9NRW1 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAB6BQ9NRW1 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAB6BQ9NRW1 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAB6BQ9NRW1 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAB6BQ9NRW1 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
RAB6BQ9NRW1 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB6BQ9NRW1 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB6BQ9NRW1 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB6BQ9NRW1 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB6BQ9NRW1 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB6BQ9NRW1 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB6BQ9NRW1 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB6BQ9NRW1 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB6BQ9NRW1 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB6BQ9NRW1 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB6BQ9NRW1 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB6BQ9NRW1 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB6BQ9NRW1 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB6BQ9NRW1 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB6BQ9NRW1 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB6BQ9NRW1 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB6BQ9NRW1 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB6BQ9NRW1 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB6BQ9NRW1 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB6BQ9NRW1 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB6BQ9NRW1 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB6BQ9NRW1 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB6BQ9NRW1 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB6BQ9NRW1 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB6BQ9NRW1 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB6BQ9NRW1 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB6BQ9NRW1 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB6BQ9NRW1 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB6BQ9NRW1 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB6BQ9NRW1 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB6BQ9NRW1 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB6BQ9NRW1 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB6BQ9NRW1 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB6BQ9NRW1 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB6BQ9NRW1 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB6BQ9NRW1 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB6BQ9NRW1 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB6BQ9NRW1 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB6BQ9NRW1 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB6BQ9NRW1 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB6BQ9NRW1 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB6BQ9NRW1 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB6BQ9NRW1 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB6BQ9NRW1 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB6BQ9NRW1 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB6BQ9NRW1 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB6BQ9NRW1 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB6BQ9NRW1 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB6BQ9NRW1 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB6BQ9NRW1 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB6BQ9NRW1 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB6BQ9NRW1 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB6BQ9NRW1 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB6BQ9NRW1 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB6BQ9NRW1 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB6BQ9NRW1 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB6BQ9NRW1 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB6BQ9NRW1 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB6BQ9NRW1 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB6BQ9NRW1 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB6BQ9NRW1 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB6BQ9NRW1 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB6BQ9NRW1 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB6BQ9NRW1 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB6BQ9NRW1 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB6BQ9NRW1 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB6BQ9NRW1 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB6BQ9NRW1 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB6BQ9NRW1 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB6BQ9NRW1 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB6BQ9NRW1 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms