Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR3

CDC42SE2, CDC42 small effector protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 84 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42SE2Q9NRR3 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDC42SE2Q9NRR3 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDC42SE2Q9NRR3 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDC42SE2Q9NRR3 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDC42SE2Q9NRR3 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDC42SE2Q9NRR3 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDC42SE2Q9NRR3 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDC42SE2Q9NRR3 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDC42SE2Q9NRR3 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDC42SE2Q9NRR3 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDC42SE2Q9NRR3 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CDC42SE2Q9NRR3 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDC42SE2Q9NRR3 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDC42SE2Q9NRR3 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDC42SE2Q9NRR3 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDC42SE2Q9NRR3 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDC42SE2Q9NRR3 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDC42SE2Q9NRR3 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDC42SE2Q9NRR3 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDC42SE2Q9NRR3 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDC42SE2Q9NRR3 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDC42SE2Q9NRR3 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDC42SE2Q9NRR3 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDC42SE2Q9NRR3 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDC42SE2Q9NRR3 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDC42SE2Q9NRR3 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDC42SE2Q9NRR3 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDC42SE2Q9NRR3 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDC42SE2Q9NRR3 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDC42SE2Q9NRR3 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDC42SE2Q9NRR3 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDC42SE2Q9NRR3 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDC42SE2Q9NRR3 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDC42SE2Q9NRR3 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDC42SE2Q9NRR3 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDC42SE2Q9NRR3 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDC42SE2Q9NRR3 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDC42SE2Q9NRR3 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDC42SE2Q9NRR3 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDC42SE2Q9NRR3 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDC42SE2Q9NRR3 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDC42SE2Q9NRR3 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDC42SE2Q9NRR3 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDC42SE2Q9NRR3 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDC42SE2Q9NRR3 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDC42SE2Q9NRR3 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDC42SE2Q9NRR3 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDC42SE2Q9NRR3 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDC42SE2Q9NRR3 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDC42SE2Q9NRR3 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDC42SE2Q9NRR3 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDC42SE2Q9NRR3 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDC42SE2Q9NRR3 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDC42SE2Q9NRR3 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDC42SE2Q9NRR3 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDC42SE2Q9NRR3 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDC42SE2Q9NRR3 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDC42SE2Q9NRR3 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDC42SE2Q9NRR3 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDC42SE2Q9NRR3 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDC42SE2Q9NRR3 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDC42SE2Q9NRR3 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDC42SE2Q9NRR3 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDC42SE2Q9NRR3 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDC42SE2Q9NRR3 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CDC42SE2Q9NRR3 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDC42SE2Q9NRR3 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDC42SE2Q9NRR3 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CDC42SE2Q9NRR3 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDC42SE2Q9NRR3 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDC42SE2Q9NRR3 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDC42SE2Q9NRR3 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDC42SE2Q9NRR3 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDC42SE2Q9NRR3 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDC42SE2Q9NRR3 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDC42SE2Q9NRR3 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDC42SE2Q9NRR3 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CDC42SE2Q9NRR3 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CDC42SE2Q9NRR3 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDC42SE2Q9NRR3 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDC42SE2Q9NRR3 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDC42SE2Q9NRR3 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDC42SE2Q9NRR3 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDC42SE2Q9NRR3 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDC42SE2Q9NRR3 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDC42SE2Q9NRR3 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDC42SE2Q9NRR3 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDC42SE2Q9NRR3 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDC42SE2Q9NRR3 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDC42SE2Q9NRR3 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDC42SE2Q9NRR3 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDC42SE2Q9NRR3 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDC42SE2Q9NRR3 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDC42SE2Q9NRR3 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDC42SE2Q9NRR3 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDC42SE2Q9NRR3 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDC42SE2Q9NRR3 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDC42SE2Q9NRR3 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDC42SE2Q9NRR3 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDC42SE2Q9NRR3 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms