Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRF8

CTPS2, CTP synthase 2, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS2Q9NRF8 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTPS2Q9NRF8 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTPS2Q9NRF8 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTPS2Q9NRF8 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTPS2Q9NRF8 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTPS2Q9NRF8 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTPS2Q9NRF8 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTPS2Q9NRF8 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTPS2Q9NRF8 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTPS2Q9NRF8 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTPS2Q9NRF8 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CTPS2Q9NRF8 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CTPS2Q9NRF8 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CTPS2Q9NRF8 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CTPS2Q9NRF8 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CTPS2Q9NRF8 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CTPS2Q9NRF8 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CTPS2Q9NRF8 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CTPS2Q9NRF8 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CTPS2Q9NRF8 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CTPS2Q9NRF8 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CTPS2Q9NRF8 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CTPS2Q9NRF8 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CTPS2Q9NRF8 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CTPS2Q9NRF8 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CTPS2Q9NRF8 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CTPS2Q9NRF8 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CTPS2Q9NRF8 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CTPS2Q9NRF8 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CTPS2Q9NRF8 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CTPS2Q9NRF8 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CTPS2Q9NRF8 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CTPS2Q9NRF8 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTPS2Q9NRF8 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTPS2Q9NRF8 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTPS2Q9NRF8 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTPS2Q9NRF8 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTPS2Q9NRF8 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTPS2Q9NRF8 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTPS2Q9NRF8 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTPS2Q9NRF8 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CTPS2Q9NRF8 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTPS2Q9NRF8 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTPS2Q9NRF8 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTPS2Q9NRF8 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTPS2Q9NRF8 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTPS2Q9NRF8 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTPS2Q9NRF8 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTPS2Q9NRF8 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTPS2Q9NRF8 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTPS2Q9NRF8 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTPS2Q9NRF8 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CTPS2Q9NRF8 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CTPS2Q9NRF8 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CTPS2Q9NRF8 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CTPS2Q9NRF8 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CTPS2Q9NRF8 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CTPS2Q9NRF8 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CTPS2Q9NRF8 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CTPS2Q9NRF8 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CTPS2Q9NRF8 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CTPS2Q9NRF8 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CTPS2Q9NRF8 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CTPS2Q9NRF8 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CTPS2Q9NRF8 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CTPS2Q9NRF8 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CTPS2Q9NRF8 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CTPS2Q9NRF8 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CTPS2Q9NRF8 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CTPS2Q9NRF8 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CTPS2Q9NRF8 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CTPS2Q9NRF8 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CTPS2Q9NRF8 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CTPS2Q9NRF8 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CTPS2Q9NRF8 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CTPS2Q9NRF8 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CTPS2Q9NRF8 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CTPS2Q9NRF8 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CTPS2Q9NRF8 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CTPS2Q9NRF8 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CTPS2Q9NRF8 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CTPS2Q9NRF8 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CTPS2Q9NRF8 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CTPS2Q9NRF8 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CTPS2Q9NRF8 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CTPS2Q9NRF8 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CTPS2Q9NRF8 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CTPS2Q9NRF8 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CTPS2Q9NRF8 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CTPS2Q9NRF8 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CTPS2Q9NRF8 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CTPS2Q9NRF8 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CTPS2Q9NRF8 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CTPS2Q9NRF8 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CTPS2Q9NRF8 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CTPS2Q9NRF8 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CTPS2Q9NRF8 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CTPS2Q9NRF8 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CTPS2Q9NRF8 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CTPS2Q9NRF8 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms