Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR31

SAR1A, GTP-binding protein SAR1a, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAR1AQ9NR31 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SAR1AQ9NR31 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SAR1AQ9NR31 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SAR1AQ9NR31 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SAR1AQ9NR31 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SAR1AQ9NR31 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SAR1AQ9NR31 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SAR1AQ9NR31 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SAR1AQ9NR31 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SAR1AQ9NR31 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SAR1AQ9NR31 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SAR1AQ9NR31 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SAR1AQ9NR31 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SAR1AQ9NR31 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SAR1AQ9NR31 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SAR1AQ9NR31 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SAR1AQ9NR31 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SAR1AQ9NR31 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SAR1AQ9NR31 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SAR1AQ9NR31 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SAR1AQ9NR31 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SAR1AQ9NR31 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SAR1AQ9NR31 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SAR1AQ9NR31 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SAR1AQ9NR31 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SAR1AQ9NR31 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SAR1AQ9NR31 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SAR1AQ9NR31 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SAR1AQ9NR31 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SAR1AQ9NR31 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SAR1AQ9NR31 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SAR1AQ9NR31 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SAR1AQ9NR31 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SAR1AQ9NR31 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SAR1AQ9NR31 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SAR1AQ9NR31 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SAR1AQ9NR31 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SAR1AQ9NR31 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SAR1AQ9NR31 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SAR1AQ9NR31 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SAR1AQ9NR31 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SAR1AQ9NR31 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SAR1AQ9NR31 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SAR1AQ9NR31 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SAR1AQ9NR31 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SAR1AQ9NR31 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SAR1AQ9NR31 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SAR1AQ9NR31 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SAR1AQ9NR31 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SAR1AQ9NR31 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SAR1AQ9NR31 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SAR1AQ9NR31 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SAR1AQ9NR31 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SAR1AQ9NR31 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SAR1AQ9NR31 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SAR1AQ9NR31 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SAR1AQ9NR31 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SAR1AQ9NR31 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SAR1AQ9NR31 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SAR1AQ9NR31 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SAR1AQ9NR31 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SAR1AQ9NR31 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SAR1AQ9NR31 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SAR1AQ9NR31 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SAR1AQ9NR31 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SAR1AQ9NR31 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SAR1AQ9NR31 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SAR1AQ9NR31 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SAR1AQ9NR31 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SAR1AQ9NR31 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SAR1AQ9NR31 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SAR1AQ9NR31 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SAR1AQ9NR31 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SAR1AQ9NR31 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SAR1AQ9NR31 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SAR1AQ9NR31 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SAR1AQ9NR31 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SAR1AQ9NR31 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SAR1AQ9NR31 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SAR1AQ9NR31 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SAR1AQ9NR31 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SAR1AQ9NR31 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SAR1AQ9NR31 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SAR1AQ9NR31 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SAR1AQ9NR31 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SAR1AQ9NR31 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SAR1AQ9NR31 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SAR1AQ9NR31 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SAR1AQ9NR31 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SAR1AQ9NR31 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SAR1AQ9NR31 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SAR1AQ9NR31 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SAR1AQ9NR31 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SAR1AQ9NR31 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SAR1AQ9NR31 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SAR1AQ9NR31 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SAR1AQ9NR31 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SAR1AQ9NR31 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SAR1AQ9NR31 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SAR1AQ9NR31 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms