Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQX1

PRDM5, PR domain zinc finger protein 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM5Q9NQX1 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRDM5Q9NQX1 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRDM5Q9NQX1 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRDM5Q9NQX1 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRDM5Q9NQX1 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRDM5Q9NQX1 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PRDM5Q9NQX1 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRDM5Q9NQX1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRDM5Q9NQX1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRDM5Q9NQX1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRDM5Q9NQX1 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRDM5Q9NQX1 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRDM5Q9NQX1 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRDM5Q9NQX1 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRDM5Q9NQX1 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PRDM5Q9NQX1 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRDM5Q9NQX1 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRDM5Q9NQX1 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRDM5Q9NQX1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRDM5Q9NQX1 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PRDM5Q9NQX1 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRDM5Q9NQX1 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRDM5Q9NQX1 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRDM5Q9NQX1 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRDM5Q9NQX1 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRDM5Q9NQX1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRDM5Q9NQX1 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRDM5Q9NQX1 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRDM5Q9NQX1 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRDM5Q9NQX1 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRDM5Q9NQX1 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRDM5Q9NQX1 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRDM5Q9NQX1 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRDM5Q9NQX1 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRDM5Q9NQX1 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRDM5Q9NQX1 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PRDM5Q9NQX1 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRDM5Q9NQX1 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRDM5Q9NQX1 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRDM5Q9NQX1 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRDM5Q9NQX1 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRDM5Q9NQX1 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRDM5Q9NQX1 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRDM5Q9NQX1 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRDM5Q9NQX1 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRDM5Q9NQX1 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRDM5Q9NQX1 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRDM5Q9NQX1 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRDM5Q9NQX1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRDM5Q9NQX1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRDM5Q9NQX1 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRDM5Q9NQX1 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRDM5Q9NQX1 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRDM5Q9NQX1 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRDM5Q9NQX1 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRDM5Q9NQX1 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRDM5Q9NQX1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRDM5Q9NQX1 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRDM5Q9NQX1 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRDM5Q9NQX1 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRDM5Q9NQX1 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRDM5Q9NQX1 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRDM5Q9NQX1 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRDM5Q9NQX1 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRDM5Q9NQX1 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PRDM5Q9NQX1 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRDM5Q9NQX1 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRDM5Q9NQX1 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRDM5Q9NQX1 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRDM5Q9NQX1 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRDM5Q9NQX1 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRDM5Q9NQX1 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRDM5Q9NQX1 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRDM5Q9NQX1 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
PRDM5Q9NQX1 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRDM5Q9NQX1 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRDM5Q9NQX1 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRDM5Q9NQX1 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRDM5Q9NQX1 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRDM5Q9NQX1 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRDM5Q9NQX1 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRDM5Q9NQX1 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRDM5Q9NQX1 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRDM5Q9NQX1 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRDM5Q9NQX1 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRDM5Q9NQX1 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRDM5Q9NQX1 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRDM5Q9NQX1 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRDM5Q9NQX1 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRDM5Q9NQX1 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRDM5Q9NQX1 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRDM5Q9NQX1 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PRDM5Q9NQX1 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PRDM5Q9NQX1 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRDM5Q9NQX1 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRDM5Q9NQX1 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PRDM5Q9NQX1 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRDM5Q9NQX1 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRDM5Q9NQX1 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRDM5Q9NQX1 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
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