Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ40

SLC52A3, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC52A3Q9NQ40 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC52A3Q9NQ40 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC52A3Q9NQ40 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC52A3Q9NQ40 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC52A3Q9NQ40 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC52A3Q9NQ40 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
SLC52A3Q9NQ40 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC52A3Q9NQ40 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC52A3Q9NQ40 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC52A3Q9NQ40 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC52A3Q9NQ40 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC52A3Q9NQ40 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC52A3Q9NQ40 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC52A3Q9NQ40 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC52A3Q9NQ40 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC52A3Q9NQ40 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC52A3Q9NQ40 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC52A3Q9NQ40 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC52A3Q9NQ40 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC52A3Q9NQ40 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC52A3Q9NQ40 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC52A3Q9NQ40 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC52A3Q9NQ40 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC52A3Q9NQ40 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC52A3Q9NQ40 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC52A3Q9NQ40 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC52A3Q9NQ40 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC52A3Q9NQ40 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC52A3Q9NQ40 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC52A3Q9NQ40 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC52A3Q9NQ40 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC52A3Q9NQ40 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC52A3Q9NQ40 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC52A3Q9NQ40 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC52A3Q9NQ40 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC52A3Q9NQ40 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC52A3Q9NQ40 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC52A3Q9NQ40 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC52A3Q9NQ40 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC52A3Q9NQ40 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC52A3Q9NQ40 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC52A3Q9NQ40 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC52A3Q9NQ40 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC52A3Q9NQ40 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC52A3Q9NQ40 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC52A3Q9NQ40 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC52A3Q9NQ40 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC52A3Q9NQ40 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC52A3Q9NQ40 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC52A3Q9NQ40 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC52A3Q9NQ40 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC52A3Q9NQ40 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC52A3Q9NQ40 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC52A3Q9NQ40 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC52A3Q9NQ40 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC52A3Q9NQ40 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC52A3Q9NQ40 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC52A3Q9NQ40 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC52A3Q9NQ40 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC52A3Q9NQ40 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC52A3Q9NQ40 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC52A3Q9NQ40 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC52A3Q9NQ40 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC52A3Q9NQ40 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC52A3Q9NQ40 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC52A3Q9NQ40 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SLC52A3Q9NQ40 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SLC52A3Q9NQ40 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SLC52A3Q9NQ40 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC52A3Q9NQ40 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC52A3Q9NQ40 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC52A3Q9NQ40 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC52A3Q9NQ40 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC52A3Q9NQ40 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC52A3Q9NQ40 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC52A3Q9NQ40 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC52A3Q9NQ40 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC52A3Q9NQ40 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC52A3Q9NQ40 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC52A3Q9NQ40 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC52A3Q9NQ40 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC52A3Q9NQ40 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC52A3Q9NQ40 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC52A3Q9NQ40 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC52A3Q9NQ40 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC52A3Q9NQ40 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC52A3Q9NQ40 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC52A3Q9NQ40 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC52A3Q9NQ40 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC52A3Q9NQ40 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC52A3Q9NQ40 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC52A3Q9NQ40 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC52A3Q9NQ40 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC52A3Q9NQ40 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC52A3Q9NQ40 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC52A3Q9NQ40 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC52A3Q9NQ40 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC52A3Q9NQ40 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC52A3Q9NQ40 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC52A3Q9NQ40 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms