Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ33

ASCL3, Achaete-scute homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL3Q9NQ33 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ASCL3Q9NQ33 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ASCL3Q9NQ33 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ASCL3Q9NQ33 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ASCL3Q9NQ33 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ASCL3Q9NQ33 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ASCL3Q9NQ33 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ASCL3Q9NQ33 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ASCL3Q9NQ33 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ASCL3Q9NQ33 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ASCL3Q9NQ33 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ASCL3Q9NQ33 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ASCL3Q9NQ33 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ASCL3Q9NQ33 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ASCL3Q9NQ33 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ASCL3Q9NQ33 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ASCL3Q9NQ33 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ASCL3Q9NQ33 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ASCL3Q9NQ33 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ASCL3Q9NQ33 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ASCL3Q9NQ33 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ASCL3Q9NQ33 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ASCL3Q9NQ33 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ASCL3Q9NQ33 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ASCL3Q9NQ33 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ASCL3Q9NQ33 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ASCL3Q9NQ33 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ASCL3Q9NQ33 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ASCL3Q9NQ33 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ASCL3Q9NQ33 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ASCL3Q9NQ33 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ASCL3Q9NQ33 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ASCL3Q9NQ33 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ASCL3Q9NQ33 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ASCL3Q9NQ33 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ASCL3Q9NQ33 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ASCL3Q9NQ33 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ASCL3Q9NQ33 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ASCL3Q9NQ33 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ASCL3Q9NQ33 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ASCL3Q9NQ33 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ASCL3Q9NQ33 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ASCL3Q9NQ33 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ASCL3Q9NQ33 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ASCL3Q9NQ33 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ASCL3Q9NQ33 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ASCL3Q9NQ33 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ASCL3Q9NQ33 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ASCL3Q9NQ33 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ASCL3Q9NQ33 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ASCL3Q9NQ33 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ASCL3Q9NQ33 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ASCL3Q9NQ33 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ASCL3Q9NQ33 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ASCL3Q9NQ33 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ASCL3Q9NQ33 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ASCL3Q9NQ33 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ASCL3Q9NQ33 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ASCL3Q9NQ33 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ASCL3Q9NQ33 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ASCL3Q9NQ33 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ASCL3Q9NQ33 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ASCL3Q9NQ33 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ASCL3Q9NQ33 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ASCL3Q9NQ33 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ASCL3Q9NQ33 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ASCL3Q9NQ33 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ASCL3Q9NQ33 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
ASCL3Q9NQ33 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ASCL3Q9NQ33 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ASCL3Q9NQ33 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ASCL3Q9NQ33 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ASCL3Q9NQ33 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
ASCL3Q9NQ33 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ASCL3Q9NQ33 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ASCL3Q9NQ33 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ASCL3Q9NQ33 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ASCL3Q9NQ33 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ASCL3Q9NQ33 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ASCL3Q9NQ33 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ASCL3Q9NQ33 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ASCL3Q9NQ33 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ASCL3Q9NQ33 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ASCL3Q9NQ33 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ASCL3Q9NQ33 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ASCL3Q9NQ33 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ASCL3Q9NQ33 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ASCL3Q9NQ33 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ASCL3Q9NQ33 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ASCL3Q9NQ33 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ASCL3Q9NQ33 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ASCL3Q9NQ33 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ASCL3Q9NQ33 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ASCL3Q9NQ33 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ASCL3Q9NQ33 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ASCL3Q9NQ33 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ASCL3Q9NQ33 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ASCL3Q9NQ33 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ASCL3Q9NQ33 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ASCL3Q9NQ33 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.5 ms