Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPR2

SEMA4B, Semaphorin-4B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4BQ9NPR2 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEMA4BQ9NPR2 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEMA4BQ9NPR2 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEMA4BQ9NPR2 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEMA4BQ9NPR2 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEMA4BQ9NPR2 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEMA4BQ9NPR2 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEMA4BQ9NPR2 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEMA4BQ9NPR2 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SEMA4BQ9NPR2 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEMA4BQ9NPR2 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEMA4BQ9NPR2 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEMA4BQ9NPR2 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEMA4BQ9NPR2 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEMA4BQ9NPR2 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEMA4BQ9NPR2 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEMA4BQ9NPR2 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEMA4BQ9NPR2 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEMA4BQ9NPR2 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEMA4BQ9NPR2 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEMA4BQ9NPR2 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEMA4BQ9NPR2 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEMA4BQ9NPR2 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEMA4BQ9NPR2 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEMA4BQ9NPR2 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEMA4BQ9NPR2 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEMA4BQ9NPR2 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEMA4BQ9NPR2 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEMA4BQ9NPR2 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEMA4BQ9NPR2 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEMA4BQ9NPR2 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEMA4BQ9NPR2 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEMA4BQ9NPR2 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEMA4BQ9NPR2 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEMA4BQ9NPR2 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEMA4BQ9NPR2 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEMA4BQ9NPR2 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SEMA4BQ9NPR2 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEMA4BQ9NPR2 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEMA4BQ9NPR2 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEMA4BQ9NPR2 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEMA4BQ9NPR2 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEMA4BQ9NPR2 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEMA4BQ9NPR2 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEMA4BQ9NPR2 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SEMA4BQ9NPR2 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEMA4BQ9NPR2 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEMA4BQ9NPR2 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SEMA4BQ9NPR2 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SEMA4BQ9NPR2 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEMA4BQ9NPR2 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEMA4BQ9NPR2 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEMA4BQ9NPR2 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEMA4BQ9NPR2 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SEMA4BQ9NPR2 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEMA4BQ9NPR2 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEMA4BQ9NPR2 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEMA4BQ9NPR2 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEMA4BQ9NPR2 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEMA4BQ9NPR2 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEMA4BQ9NPR2 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEMA4BQ9NPR2 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEMA4BQ9NPR2 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEMA4BQ9NPR2 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEMA4BQ9NPR2 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEMA4BQ9NPR2 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEMA4BQ9NPR2 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEMA4BQ9NPR2 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEMA4BQ9NPR2 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEMA4BQ9NPR2 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEMA4BQ9NPR2 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEMA4BQ9NPR2 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEMA4BQ9NPR2 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEMA4BQ9NPR2 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SEMA4BQ9NPR2 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEMA4BQ9NPR2 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEMA4BQ9NPR2 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEMA4BQ9NPR2 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEMA4BQ9NPR2 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEMA4BQ9NPR2 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEMA4BQ9NPR2 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEMA4BQ9NPR2 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEMA4BQ9NPR2 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEMA4BQ9NPR2 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEMA4BQ9NPR2 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEMA4BQ9NPR2 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEMA4BQ9NPR2 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEMA4BQ9NPR2 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SEMA4BQ9NPR2 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEMA4BQ9NPR2 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEMA4BQ9NPR2 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEMA4BQ9NPR2 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEMA4BQ9NPR2 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEMA4BQ9NPR2 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEMA4BQ9NPR2 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEMA4BQ9NPR2 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEMA4BQ9NPR2 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEMA4BQ9NPR2 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEMA4BQ9NPR2 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEMA4BQ9NPR2 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms