Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPP4

NLRC4, NLR family CARD domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRC4Q9NPP4 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NLRC4Q9NPP4 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NLRC4Q9NPP4 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NLRC4Q9NPP4 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NLRC4Q9NPP4 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NLRC4Q9NPP4 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NLRC4Q9NPP4 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NLRC4Q9NPP4 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NLRC4Q9NPP4 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NLRC4Q9NPP4 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NLRC4Q9NPP4 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NLRC4Q9NPP4 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NLRC4Q9NPP4 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NLRC4Q9NPP4 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NLRC4Q9NPP4 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NLRC4Q9NPP4 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NLRC4Q9NPP4 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NLRC4Q9NPP4 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NLRC4Q9NPP4 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NLRC4Q9NPP4 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NLRC4Q9NPP4 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NLRC4Q9NPP4 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NLRC4Q9NPP4 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NLRC4Q9NPP4 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NLRC4Q9NPP4 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NLRC4Q9NPP4 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NLRC4Q9NPP4 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NLRC4Q9NPP4 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
NLRC4Q9NPP4 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NLRC4Q9NPP4 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NLRC4Q9NPP4 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NLRC4Q9NPP4 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NLRC4Q9NPP4 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NLRC4Q9NPP4 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NLRC4Q9NPP4 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NLRC4Q9NPP4 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NLRC4Q9NPP4 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NLRC4Q9NPP4 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NLRC4Q9NPP4 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NLRC4Q9NPP4 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NLRC4Q9NPP4 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NLRC4Q9NPP4 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NLRC4Q9NPP4 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NLRC4Q9NPP4 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NLRC4Q9NPP4 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NLRC4Q9NPP4 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NLRC4Q9NPP4 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NLRC4Q9NPP4 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NLRC4Q9NPP4 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NLRC4Q9NPP4 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NLRC4Q9NPP4 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NLRC4Q9NPP4 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NLRC4Q9NPP4 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NLRC4Q9NPP4 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NLRC4Q9NPP4 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NLRC4Q9NPP4 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NLRC4Q9NPP4 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NLRC4Q9NPP4 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NLRC4Q9NPP4 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NLRC4Q9NPP4 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NLRC4Q9NPP4 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NLRC4Q9NPP4 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
NLRC4Q9NPP4 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NLRC4Q9NPP4 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NLRC4Q9NPP4 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NLRC4Q9NPP4 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NLRC4Q9NPP4 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NLRC4Q9NPP4 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NLRC4Q9NPP4 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
NLRC4Q9NPP4 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NLRC4Q9NPP4 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NLRC4Q9NPP4 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NLRC4Q9NPP4 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NLRC4Q9NPP4 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NLRC4Q9NPP4 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NLRC4Q9NPP4 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NLRC4Q9NPP4 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NLRC4Q9NPP4 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NLRC4Q9NPP4 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NLRC4Q9NPP4 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NLRC4Q9NPP4 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NLRC4Q9NPP4 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NLRC4Q9NPP4 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NLRC4Q9NPP4 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
NLRC4Q9NPP4 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NLRC4Q9NPP4 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NLRC4Q9NPP4 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
NLRC4Q9NPP4 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
NLRC4Q9NPP4 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
NLRC4Q9NPP4 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
NLRC4Q9NPP4 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NLRC4Q9NPP4 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NLRC4Q9NPP4 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NLRC4Q9NPP4 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NLRC4Q9NPP4 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NLRC4Q9NPP4 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NLRC4Q9NPP4 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NLRC4Q9NPP4 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NLRC4Q9NPP4 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NLRC4Q9NPP4 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms