Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC2

KCNK9, Potassium channel subfamily K member 9, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNK9Q9NPC2 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KCNK9Q9NPC2 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KCNK9Q9NPC2 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KCNK9Q9NPC2 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KCNK9Q9NPC2 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KCNK9Q9NPC2 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KCNK9Q9NPC2 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KCNK9Q9NPC2 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KCNK9Q9NPC2 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KCNK9Q9NPC2 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KCNK9Q9NPC2 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KCNK9Q9NPC2 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KCNK9Q9NPC2 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KCNK9Q9NPC2 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KCNK9Q9NPC2 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KCNK9Q9NPC2 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KCNK9Q9NPC2 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KCNK9Q9NPC2 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KCNK9Q9NPC2 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KCNK9Q9NPC2 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KCNK9Q9NPC2 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KCNK9Q9NPC2 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KCNK9Q9NPC2 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KCNK9Q9NPC2 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KCNK9Q9NPC2 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KCNK9Q9NPC2 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KCNK9Q9NPC2 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KCNK9Q9NPC2 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KCNK9Q9NPC2 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KCNK9Q9NPC2 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KCNK9Q9NPC2 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KCNK9Q9NPC2 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KCNK9Q9NPC2 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KCNK9Q9NPC2 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
KCNK9Q9NPC2 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KCNK9Q9NPC2 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KCNK9Q9NPC2 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KCNK9Q9NPC2 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KCNK9Q9NPC2 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KCNK9Q9NPC2 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KCNK9Q9NPC2 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KCNK9Q9NPC2 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KCNK9Q9NPC2 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KCNK9Q9NPC2 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KCNK9Q9NPC2 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KCNK9Q9NPC2 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KCNK9Q9NPC2 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KCNK9Q9NPC2 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KCNK9Q9NPC2 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KCNK9Q9NPC2 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KCNK9Q9NPC2 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KCNK9Q9NPC2 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KCNK9Q9NPC2 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KCNK9Q9NPC2 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KCNK9Q9NPC2 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KCNK9Q9NPC2 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KCNK9Q9NPC2 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KCNK9Q9NPC2 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
KCNK9Q9NPC2 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KCNK9Q9NPC2 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KCNK9Q9NPC2 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KCNK9Q9NPC2 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KCNK9Q9NPC2 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KCNK9Q9NPC2 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KCNK9Q9NPC2 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KCNK9Q9NPC2 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KCNK9Q9NPC2 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KCNK9Q9NPC2 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KCNK9Q9NPC2 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KCNK9Q9NPC2 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
KCNK9Q9NPC2 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KCNK9Q9NPC2 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
KCNK9Q9NPC2 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KCNK9Q9NPC2 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KCNK9Q9NPC2 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KCNK9Q9NPC2 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KCNK9Q9NPC2 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KCNK9Q9NPC2 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KCNK9Q9NPC2 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KCNK9Q9NPC2 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KCNK9Q9NPC2 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KCNK9Q9NPC2 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KCNK9Q9NPC2 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KCNK9Q9NPC2 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
KCNK9Q9NPC2 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KCNK9Q9NPC2 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KCNK9Q9NPC2 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KCNK9Q9NPC2 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KCNK9Q9NPC2 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KCNK9Q9NPC2 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KCNK9Q9NPC2 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KCNK9Q9NPC2 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KCNK9Q9NPC2 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KCNK9Q9NPC2 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KCNK9Q9NPC2 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KCNK9Q9NPC2 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KCNK9Q9NPC2 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
KCNK9Q9NPC2 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KCNK9Q9NPC2 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KCNK9Q9NPC2 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms