Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP80

PNPLA8, Calcium-independent phospholipase A2-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNPLA8Q9NP80 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PNPLA8Q9NP80 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PNPLA8Q9NP80 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PNPLA8Q9NP80 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PNPLA8Q9NP80 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PNPLA8Q9NP80 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PNPLA8Q9NP80 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PNPLA8Q9NP80 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PNPLA8Q9NP80 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PNPLA8Q9NP80 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PNPLA8Q9NP80 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PNPLA8Q9NP80 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PNPLA8Q9NP80 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PNPLA8Q9NP80 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PNPLA8Q9NP80 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PNPLA8Q9NP80 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PNPLA8Q9NP80 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PNPLA8Q9NP80 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PNPLA8Q9NP80 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PNPLA8Q9NP80 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PNPLA8Q9NP80 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PNPLA8Q9NP80 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PNPLA8Q9NP80 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PNPLA8Q9NP80 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PNPLA8Q9NP80 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PNPLA8Q9NP80 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PNPLA8Q9NP80 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PNPLA8Q9NP80 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PNPLA8Q9NP80 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PNPLA8Q9NP80 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PNPLA8Q9NP80 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PNPLA8Q9NP80 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PNPLA8Q9NP80 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PNPLA8Q9NP80 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PNPLA8Q9NP80 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PNPLA8Q9NP80 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PNPLA8Q9NP80 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PNPLA8Q9NP80 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PNPLA8Q9NP80 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PNPLA8Q9NP80 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PNPLA8Q9NP80 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PNPLA8Q9NP80 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PNPLA8Q9NP80 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PNPLA8Q9NP80 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PNPLA8Q9NP80 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PNPLA8Q9NP80 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PNPLA8Q9NP80 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PNPLA8Q9NP80 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PNPLA8Q9NP80 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PNPLA8Q9NP80 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PNPLA8Q9NP80 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PNPLA8Q9NP80 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PNPLA8Q9NP80 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PNPLA8Q9NP80 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PNPLA8Q9NP80 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PNPLA8Q9NP80 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PNPLA8Q9NP80 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PNPLA8Q9NP80 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PNPLA8Q9NP80 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PNPLA8Q9NP80 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PNPLA8Q9NP80 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PNPLA8Q9NP80 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PNPLA8Q9NP80 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
PNPLA8Q9NP80 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PNPLA8Q9NP80 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PNPLA8Q9NP80 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PNPLA8Q9NP80 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PNPLA8Q9NP80 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PNPLA8Q9NP80 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PNPLA8Q9NP80 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PNPLA8Q9NP80 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PNPLA8Q9NP80 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PNPLA8Q9NP80 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PNPLA8Q9NP80 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PNPLA8Q9NP80 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PNPLA8Q9NP80 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PNPLA8Q9NP80 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PNPLA8Q9NP80 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PNPLA8Q9NP80 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PNPLA8Q9NP80 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PNPLA8Q9NP80 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PNPLA8Q9NP80 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PNPLA8Q9NP80 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PNPLA8Q9NP80 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PNPLA8Q9NP80 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PNPLA8Q9NP80 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PNPLA8Q9NP80 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PNPLA8Q9NP80 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PNPLA8Q9NP80 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PNPLA8Q9NP80 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PNPLA8Q9NP80 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PNPLA8Q9NP80 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PNPLA8Q9NP80 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PNPLA8Q9NP80 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PNPLA8Q9NP80 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PNPLA8Q9NP80 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PNPLA8Q9NP80 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PNPLA8Q9NP80 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PNPLA8Q9NP80 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PNPLA8Q9NP80 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms