Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP56

PDE7B, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 7B, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE7BQ9NP56 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDE7BQ9NP56 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDE7BQ9NP56 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDE7BQ9NP56 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDE7BQ9NP56 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PDE7BQ9NP56 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDE7BQ9NP56 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDE7BQ9NP56 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDE7BQ9NP56 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PDE7BQ9NP56 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDE7BQ9NP56 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDE7BQ9NP56 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDE7BQ9NP56 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDE7BQ9NP56 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDE7BQ9NP56 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PDE7BQ9NP56 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDE7BQ9NP56 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDE7BQ9NP56 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDE7BQ9NP56 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDE7BQ9NP56 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDE7BQ9NP56 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDE7BQ9NP56 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDE7BQ9NP56 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDE7BQ9NP56 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDE7BQ9NP56 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDE7BQ9NP56 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDE7BQ9NP56 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDE7BQ9NP56 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PDE7BQ9NP56 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDE7BQ9NP56 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDE7BQ9NP56 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDE7BQ9NP56 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDE7BQ9NP56 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PDE7BQ9NP56 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDE7BQ9NP56 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDE7BQ9NP56 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDE7BQ9NP56 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDE7BQ9NP56 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDE7BQ9NP56 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDE7BQ9NP56 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDE7BQ9NP56 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDE7BQ9NP56 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDE7BQ9NP56 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDE7BQ9NP56 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDE7BQ9NP56 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDE7BQ9NP56 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDE7BQ9NP56 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDE7BQ9NP56 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PDE7BQ9NP56 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PDE7BQ9NP56 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PDE7BQ9NP56 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PDE7BQ9NP56 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDE7BQ9NP56 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDE7BQ9NP56 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDE7BQ9NP56 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDE7BQ9NP56 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDE7BQ9NP56 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDE7BQ9NP56 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDE7BQ9NP56 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDE7BQ9NP56 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDE7BQ9NP56 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDE7BQ9NP56 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDE7BQ9NP56 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDE7BQ9NP56 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDE7BQ9NP56 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDE7BQ9NP56 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDE7BQ9NP56 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDE7BQ9NP56 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PDE7BQ9NP56 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDE7BQ9NP56 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDE7BQ9NP56 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDE7BQ9NP56 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDE7BQ9NP56 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDE7BQ9NP56 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDE7BQ9NP56 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDE7BQ9NP56 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDE7BQ9NP56 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDE7BQ9NP56 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDE7BQ9NP56 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDE7BQ9NP56 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDE7BQ9NP56 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDE7BQ9NP56 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDE7BQ9NP56 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PDE7BQ9NP56 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDE7BQ9NP56 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDE7BQ9NP56 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDE7BQ9NP56 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDE7BQ9NP56 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PDE7BQ9NP56 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDE7BQ9NP56 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDE7BQ9NP56 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDE7BQ9NP56 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDE7BQ9NP56 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDE7BQ9NP56 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDE7BQ9NP56 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDE7BQ9NP56 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PDE7BQ9NP56 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDE7BQ9NP56 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDE7BQ9NP56 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDE7BQ9NP56 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms