Protein–RNA interactions for Protein: Q9NNZ3

DNAJC4, DnaJ homolog subfamily C member 4, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC4Q9NNZ3 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DNAJC4Q9NNZ3 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DNAJC4Q9NNZ3 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DNAJC4Q9NNZ3 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DNAJC4Q9NNZ3 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DNAJC4Q9NNZ3 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DNAJC4Q9NNZ3 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DNAJC4Q9NNZ3 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DNAJC4Q9NNZ3 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DNAJC4Q9NNZ3 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DNAJC4Q9NNZ3 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DNAJC4Q9NNZ3 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DNAJC4Q9NNZ3 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DNAJC4Q9NNZ3 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
DNAJC4Q9NNZ3 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DNAJC4Q9NNZ3 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DNAJC4Q9NNZ3 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DNAJC4Q9NNZ3 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DNAJC4Q9NNZ3 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DNAJC4Q9NNZ3 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DNAJC4Q9NNZ3 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
DNAJC4Q9NNZ3 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DNAJC4Q9NNZ3 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DNAJC4Q9NNZ3 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DNAJC4Q9NNZ3 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DNAJC4Q9NNZ3 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DNAJC4Q9NNZ3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DNAJC4Q9NNZ3 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DNAJC4Q9NNZ3 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DNAJC4Q9NNZ3 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DNAJC4Q9NNZ3 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DNAJC4Q9NNZ3 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
DNAJC4Q9NNZ3 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DNAJC4Q9NNZ3 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
DNAJC4Q9NNZ3 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DNAJC4Q9NNZ3 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DNAJC4Q9NNZ3 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DNAJC4Q9NNZ3 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DNAJC4Q9NNZ3 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DNAJC4Q9NNZ3 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DNAJC4Q9NNZ3 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DNAJC4Q9NNZ3 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
DNAJC4Q9NNZ3 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DNAJC4Q9NNZ3 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DNAJC4Q9NNZ3 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DNAJC4Q9NNZ3 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
DNAJC4Q9NNZ3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DNAJC4Q9NNZ3 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DNAJC4Q9NNZ3 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DNAJC4Q9NNZ3 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DNAJC4Q9NNZ3 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DNAJC4Q9NNZ3 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DNAJC4Q9NNZ3 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DNAJC4Q9NNZ3 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DNAJC4Q9NNZ3 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DNAJC4Q9NNZ3 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DNAJC4Q9NNZ3 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DNAJC4Q9NNZ3 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
DNAJC4Q9NNZ3 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DNAJC4Q9NNZ3 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DNAJC4Q9NNZ3 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DNAJC4Q9NNZ3 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DNAJC4Q9NNZ3 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DNAJC4Q9NNZ3 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DNAJC4Q9NNZ3 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DNAJC4Q9NNZ3 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DNAJC4Q9NNZ3 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DNAJC4Q9NNZ3 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DNAJC4Q9NNZ3 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DNAJC4Q9NNZ3 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DNAJC4Q9NNZ3 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DNAJC4Q9NNZ3 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DNAJC4Q9NNZ3 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DNAJC4Q9NNZ3 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DNAJC4Q9NNZ3 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DNAJC4Q9NNZ3 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DNAJC4Q9NNZ3 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DNAJC4Q9NNZ3 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DNAJC4Q9NNZ3 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DNAJC4Q9NNZ3 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DNAJC4Q9NNZ3 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DNAJC4Q9NNZ3 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DNAJC4Q9NNZ3 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DNAJC4Q9NNZ3 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DNAJC4Q9NNZ3 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
DNAJC4Q9NNZ3 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DNAJC4Q9NNZ3 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DNAJC4Q9NNZ3 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DNAJC4Q9NNZ3 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DNAJC4Q9NNZ3 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
DNAJC4Q9NNZ3 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
DNAJC4Q9NNZ3 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
DNAJC4Q9NNZ3 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
DNAJC4Q9NNZ3 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DNAJC4Q9NNZ3 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DNAJC4Q9NNZ3 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DNAJC4Q9NNZ3 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DNAJC4Q9NNZ3 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DNAJC4Q9NNZ3 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DNAJC4Q9NNZ3 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms