Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC56

PCDH9, Protocadherin-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDH9Q9HC56 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCDH9Q9HC56 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCDH9Q9HC56 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PCDH9Q9HC56 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCDH9Q9HC56 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCDH9Q9HC56 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCDH9Q9HC56 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCDH9Q9HC56 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PCDH9Q9HC56 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCDH9Q9HC56 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCDH9Q9HC56 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCDH9Q9HC56 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCDH9Q9HC56 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCDH9Q9HC56 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCDH9Q9HC56 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PCDH9Q9HC56 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCDH9Q9HC56 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCDH9Q9HC56 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCDH9Q9HC56 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCDH9Q9HC56 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCDH9Q9HC56 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCDH9Q9HC56 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCDH9Q9HC56 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCDH9Q9HC56 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCDH9Q9HC56 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCDH9Q9HC56 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCDH9Q9HC56 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCDH9Q9HC56 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCDH9Q9HC56 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCDH9Q9HC56 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCDH9Q9HC56 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCDH9Q9HC56 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCDH9Q9HC56 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCDH9Q9HC56 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCDH9Q9HC56 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCDH9Q9HC56 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCDH9Q9HC56 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCDH9Q9HC56 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCDH9Q9HC56 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PCDH9Q9HC56 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCDH9Q9HC56 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCDH9Q9HC56 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCDH9Q9HC56 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCDH9Q9HC56 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCDH9Q9HC56 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCDH9Q9HC56 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCDH9Q9HC56 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCDH9Q9HC56 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PCDH9Q9HC56 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCDH9Q9HC56 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCDH9Q9HC56 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCDH9Q9HC56 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCDH9Q9HC56 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCDH9Q9HC56 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCDH9Q9HC56 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCDH9Q9HC56 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PCDH9Q9HC56 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCDH9Q9HC56 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCDH9Q9HC56 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCDH9Q9HC56 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCDH9Q9HC56 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCDH9Q9HC56 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCDH9Q9HC56 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCDH9Q9HC56 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCDH9Q9HC56 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCDH9Q9HC56 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCDH9Q9HC56 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCDH9Q9HC56 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCDH9Q9HC56 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCDH9Q9HC56 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCDH9Q9HC56 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCDH9Q9HC56 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCDH9Q9HC56 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCDH9Q9HC56 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCDH9Q9HC56 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCDH9Q9HC56 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCDH9Q9HC56 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCDH9Q9HC56 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCDH9Q9HC56 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCDH9Q9HC56 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCDH9Q9HC56 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCDH9Q9HC56 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PCDH9Q9HC56 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PCDH9Q9HC56 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PCDH9Q9HC56 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PCDH9Q9HC56 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCDH9Q9HC56 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCDH9Q9HC56 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCDH9Q9HC56 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCDH9Q9HC56 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCDH9Q9HC56 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCDH9Q9HC56 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCDH9Q9HC56 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCDH9Q9HC56 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCDH9Q9HC56 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCDH9Q9HC56 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCDH9Q9HC56 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PCDH9Q9HC56 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCDH9Q9HC56 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCDH9Q9HC56 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms