Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBI1

PARVB, Beta-parvin, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARVBQ9HBI1 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PARVBQ9HBI1 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PARVBQ9HBI1 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PARVBQ9HBI1 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PARVBQ9HBI1 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PARVBQ9HBI1 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PARVBQ9HBI1 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PARVBQ9HBI1 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PARVBQ9HBI1 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PARVBQ9HBI1 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PARVBQ9HBI1 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PARVBQ9HBI1 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PARVBQ9HBI1 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PARVBQ9HBI1 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PARVBQ9HBI1 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PARVBQ9HBI1 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PARVBQ9HBI1 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PARVBQ9HBI1 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PARVBQ9HBI1 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PARVBQ9HBI1 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PARVBQ9HBI1 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PARVBQ9HBI1 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PARVBQ9HBI1 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PARVBQ9HBI1 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PARVBQ9HBI1 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PARVBQ9HBI1 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PARVBQ9HBI1 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PARVBQ9HBI1 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PARVBQ9HBI1 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PARVBQ9HBI1 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PARVBQ9HBI1 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PARVBQ9HBI1 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PARVBQ9HBI1 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PARVBQ9HBI1 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PARVBQ9HBI1 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PARVBQ9HBI1 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PARVBQ9HBI1 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PARVBQ9HBI1 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PARVBQ9HBI1 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PARVBQ9HBI1 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PARVBQ9HBI1 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PARVBQ9HBI1 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PARVBQ9HBI1 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PARVBQ9HBI1 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PARVBQ9HBI1 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PARVBQ9HBI1 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PARVBQ9HBI1 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PARVBQ9HBI1 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PARVBQ9HBI1 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PARVBQ9HBI1 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PARVBQ9HBI1 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PARVBQ9HBI1 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PARVBQ9HBI1 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PARVBQ9HBI1 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PARVBQ9HBI1 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PARVBQ9HBI1 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PARVBQ9HBI1 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PARVBQ9HBI1 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PARVBQ9HBI1 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PARVBQ9HBI1 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PARVBQ9HBI1 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PARVBQ9HBI1 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PARVBQ9HBI1 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PARVBQ9HBI1 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PARVBQ9HBI1 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PARVBQ9HBI1 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PARVBQ9HBI1 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PARVBQ9HBI1 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PARVBQ9HBI1 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PARVBQ9HBI1 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PARVBQ9HBI1 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PARVBQ9HBI1 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PARVBQ9HBI1 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PARVBQ9HBI1 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PARVBQ9HBI1 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PARVBQ9HBI1 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PARVBQ9HBI1 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PARVBQ9HBI1 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PARVBQ9HBI1 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PARVBQ9HBI1 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PARVBQ9HBI1 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PARVBQ9HBI1 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PARVBQ9HBI1 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PARVBQ9HBI1 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PARVBQ9HBI1 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PARVBQ9HBI1 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PARVBQ9HBI1 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PARVBQ9HBI1 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PARVBQ9HBI1 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PARVBQ9HBI1 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PARVBQ9HBI1 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PARVBQ9HBI1 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PARVBQ9HBI1 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PARVBQ9HBI1 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PARVBQ9HBI1 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PARVBQ9HBI1 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PARVBQ9HBI1 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PARVBQ9HBI1 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PARVBQ9HBI1 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PARVBQ9HBI1 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms