Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7Z3

NRDE2, Protein NRDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRDE2Q9H7Z3 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NRDE2Q9H7Z3 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NRDE2Q9H7Z3 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NRDE2Q9H7Z3 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NRDE2Q9H7Z3 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NRDE2Q9H7Z3 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NRDE2Q9H7Z3 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NRDE2Q9H7Z3 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NRDE2Q9H7Z3 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NRDE2Q9H7Z3 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NRDE2Q9H7Z3 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NRDE2Q9H7Z3 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NRDE2Q9H7Z3 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
NRDE2Q9H7Z3 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NRDE2Q9H7Z3 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NRDE2Q9H7Z3 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NRDE2Q9H7Z3 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NRDE2Q9H7Z3 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NRDE2Q9H7Z3 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NRDE2Q9H7Z3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NRDE2Q9H7Z3 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NRDE2Q9H7Z3 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NRDE2Q9H7Z3 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
NRDE2Q9H7Z3 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
NRDE2Q9H7Z3 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
NRDE2Q9H7Z3 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NRDE2Q9H7Z3 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NRDE2Q9H7Z3 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NRDE2Q9H7Z3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NRDE2Q9H7Z3 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NRDE2Q9H7Z3 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NRDE2Q9H7Z3 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
NRDE2Q9H7Z3 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NRDE2Q9H7Z3 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
NRDE2Q9H7Z3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NRDE2Q9H7Z3 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NRDE2Q9H7Z3 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NRDE2Q9H7Z3 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NRDE2Q9H7Z3 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NRDE2Q9H7Z3 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NRDE2Q9H7Z3 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
NRDE2Q9H7Z3 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
NRDE2Q9H7Z3 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NRDE2Q9H7Z3 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NRDE2Q9H7Z3 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NRDE2Q9H7Z3 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NRDE2Q9H7Z3 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NRDE2Q9H7Z3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NRDE2Q9H7Z3 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NRDE2Q9H7Z3 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NRDE2Q9H7Z3 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
NRDE2Q9H7Z3 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NRDE2Q9H7Z3 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NRDE2Q9H7Z3 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NRDE2Q9H7Z3 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NRDE2Q9H7Z3 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NRDE2Q9H7Z3 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NRDE2Q9H7Z3 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NRDE2Q9H7Z3 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NRDE2Q9H7Z3 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
NRDE2Q9H7Z3 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
NRDE2Q9H7Z3 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NRDE2Q9H7Z3 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
NRDE2Q9H7Z3 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NRDE2Q9H7Z3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NRDE2Q9H7Z3 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NRDE2Q9H7Z3 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NRDE2Q9H7Z3 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NRDE2Q9H7Z3 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NRDE2Q9H7Z3 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NRDE2Q9H7Z3 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
NRDE2Q9H7Z3 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NRDE2Q9H7Z3 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
NRDE2Q9H7Z3 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NRDE2Q9H7Z3 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NRDE2Q9H7Z3 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NRDE2Q9H7Z3 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NRDE2Q9H7Z3 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NRDE2Q9H7Z3 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NRDE2Q9H7Z3 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
NRDE2Q9H7Z3 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NRDE2Q9H7Z3 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NRDE2Q9H7Z3 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NRDE2Q9H7Z3 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NRDE2Q9H7Z3 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NRDE2Q9H7Z3 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NRDE2Q9H7Z3 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NRDE2Q9H7Z3 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NRDE2Q9H7Z3 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NRDE2Q9H7Z3 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NRDE2Q9H7Z3 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NRDE2Q9H7Z3 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NRDE2Q9H7Z3 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NRDE2Q9H7Z3 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
NRDE2Q9H7Z3 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NRDE2Q9H7Z3 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NRDE2Q9H7Z3 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
NRDE2Q9H7Z3 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NRDE2Q9H7Z3 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NRDE2Q9H7Z3 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms