Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7N4

SCAF1, Splicing factor, arginine/serine-rich 19, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF1Q9H7N4 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
SCAF1Q9H7N4 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
SCAF1Q9H7N4 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
SCAF1Q9H7N4 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
SCAF1Q9H7N4 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
SCAF1Q9H7N4 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
SCAF1Q9H7N4 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
SCAF1Q9H7N4 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
SCAF1Q9H7N4 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
SCAF1Q9H7N4 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
SCAF1Q9H7N4 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
SCAF1Q9H7N4 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
SCAF1Q9H7N4 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
SCAF1Q9H7N4 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
SCAF1Q9H7N4 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
SCAF1Q9H7N4 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
SCAF1Q9H7N4 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
SCAF1Q9H7N4 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
SCAF1Q9H7N4 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
SCAF1Q9H7N4 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
SCAF1Q9H7N4 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
SCAF1Q9H7N4 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
SCAF1Q9H7N4 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
SCAF1Q9H7N4 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
SCAF1Q9H7N4 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
SCAF1Q9H7N4 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
SCAF1Q9H7N4 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
SCAF1Q9H7N4 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
SCAF1Q9H7N4 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
SCAF1Q9H7N4 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
SCAF1Q9H7N4 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
SCAF1Q9H7N4 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
SCAF1Q9H7N4 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
SCAF1Q9H7N4 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
SCAF1Q9H7N4 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC33.62■■■□□ 2.97
SCAF1Q9H7N4 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
SCAF1Q9H7N4 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
SCAF1Q9H7N4 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
SCAF1Q9H7N4 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
SCAF1Q9H7N4 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
SCAF1Q9H7N4 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
SCAF1Q9H7N4 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
SCAF1Q9H7N4 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
SCAF1Q9H7N4 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
SCAF1Q9H7N4 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
SCAF1Q9H7N4 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
SCAF1Q9H7N4 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
SCAF1Q9H7N4 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
SCAF1Q9H7N4 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
SCAF1Q9H7N4 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
SCAF1Q9H7N4 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC33.59■■■□□ 2.97
SCAF1Q9H7N4 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
SCAF1Q9H7N4 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
SCAF1Q9H7N4 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
SCAF1Q9H7N4 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
SCAF1Q9H7N4 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC33.58■■■□□ 2.97
SCAF1Q9H7N4 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
SCAF1Q9H7N4 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
SCAF1Q9H7N4 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC33.57■■■□□ 2.97
SCAF1Q9H7N4 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
SCAF1Q9H7N4 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.97
SCAF1Q9H7N4 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC33.57■■■□□ 2.96
SCAF1Q9H7N4 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
SCAF1Q9H7N4 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
SCAF1Q9H7N4 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
SCAF1Q9H7N4 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
SCAF1Q9H7N4 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
SCAF1Q9H7N4 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
SCAF1Q9H7N4 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC33.56■■■□□ 2.96
SCAF1Q9H7N4 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
SCAF1Q9H7N4 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
SCAF1Q9H7N4 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
SCAF1Q9H7N4 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
SCAF1Q9H7N4 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
SCAF1Q9H7N4 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
SCAF1Q9H7N4 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
SCAF1Q9H7N4 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
SCAF1Q9H7N4 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
SCAF1Q9H7N4 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
SCAF1Q9H7N4 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
SCAF1Q9H7N4 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
SCAF1Q9H7N4 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC33.54■■■□□ 2.96
SCAF1Q9H7N4 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
SCAF1Q9H7N4 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
SCAF1Q9H7N4 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
SCAF1Q9H7N4 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
SCAF1Q9H7N4 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
SCAF1Q9H7N4 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
SCAF1Q9H7N4 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
SCAF1Q9H7N4 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC33.54■■■□□ 2.96
SCAF1Q9H7N4 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
SCAF1Q9H7N4 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
SCAF1Q9H7N4 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
SCAF1Q9H7N4 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC33.53■■■□□ 2.96
SCAF1Q9H7N4 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
SCAF1Q9H7N4 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
SCAF1Q9H7N4 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
SCAF1Q9H7N4 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC33.52■■■□□ 2.96
SCAF1Q9H7N4 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
SCAF1Q9H7N4 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms