Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6H4

REEP4, Receptor expression-enhancing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REEP4Q9H6H4 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
REEP4Q9H6H4 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
REEP4Q9H6H4 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
REEP4Q9H6H4 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
REEP4Q9H6H4 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
REEP4Q9H6H4 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
REEP4Q9H6H4 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
REEP4Q9H6H4 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
REEP4Q9H6H4 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
REEP4Q9H6H4 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
REEP4Q9H6H4 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
REEP4Q9H6H4 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
REEP4Q9H6H4 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
REEP4Q9H6H4 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
REEP4Q9H6H4 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
REEP4Q9H6H4 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
REEP4Q9H6H4 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
REEP4Q9H6H4 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
REEP4Q9H6H4 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
REEP4Q9H6H4 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
REEP4Q9H6H4 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
REEP4Q9H6H4 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
REEP4Q9H6H4 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
REEP4Q9H6H4 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
REEP4Q9H6H4 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
REEP4Q9H6H4 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
REEP4Q9H6H4 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
REEP4Q9H6H4 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
REEP4Q9H6H4 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
REEP4Q9H6H4 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
REEP4Q9H6H4 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
REEP4Q9H6H4 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
REEP4Q9H6H4 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
REEP4Q9H6H4 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
REEP4Q9H6H4 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
REEP4Q9H6H4 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
REEP4Q9H6H4 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
REEP4Q9H6H4 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
REEP4Q9H6H4 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
REEP4Q9H6H4 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
REEP4Q9H6H4 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
REEP4Q9H6H4 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
REEP4Q9H6H4 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
REEP4Q9H6H4 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
REEP4Q9H6H4 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
REEP4Q9H6H4 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
REEP4Q9H6H4 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
REEP4Q9H6H4 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
REEP4Q9H6H4 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
REEP4Q9H6H4 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
REEP4Q9H6H4 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
REEP4Q9H6H4 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
REEP4Q9H6H4 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
REEP4Q9H6H4 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
REEP4Q9H6H4 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
REEP4Q9H6H4 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
REEP4Q9H6H4 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
REEP4Q9H6H4 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
REEP4Q9H6H4 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
REEP4Q9H6H4 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
REEP4Q9H6H4 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
REEP4Q9H6H4 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
REEP4Q9H6H4 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
REEP4Q9H6H4 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
REEP4Q9H6H4 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
REEP4Q9H6H4 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
REEP4Q9H6H4 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
REEP4Q9H6H4 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
REEP4Q9H6H4 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
REEP4Q9H6H4 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
REEP4Q9H6H4 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
REEP4Q9H6H4 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
REEP4Q9H6H4 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
REEP4Q9H6H4 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
REEP4Q9H6H4 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
REEP4Q9H6H4 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
REEP4Q9H6H4 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
REEP4Q9H6H4 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
REEP4Q9H6H4 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
REEP4Q9H6H4 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
REEP4Q9H6H4 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
REEP4Q9H6H4 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
REEP4Q9H6H4 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
REEP4Q9H6H4 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
REEP4Q9H6H4 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
REEP4Q9H6H4 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
REEP4Q9H6H4 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
REEP4Q9H6H4 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
REEP4Q9H6H4 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
REEP4Q9H6H4 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
REEP4Q9H6H4 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
REEP4Q9H6H4 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
REEP4Q9H6H4 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
REEP4Q9H6H4 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
REEP4Q9H6H4 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
REEP4Q9H6H4 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
REEP4Q9H6H4 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
REEP4Q9H6H4 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
REEP4Q9H6H4 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
REEP4Q9H6H4 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms