Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6D8

FNDC4, Fibronectin type III domain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC4Q9H6D8 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FNDC4Q9H6D8 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
FNDC4Q9H6D8 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FNDC4Q9H6D8 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
FNDC4Q9H6D8 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
FNDC4Q9H6D8 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FNDC4Q9H6D8 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FNDC4Q9H6D8 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FNDC4Q9H6D8 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FNDC4Q9H6D8 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FNDC4Q9H6D8 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FNDC4Q9H6D8 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FNDC4Q9H6D8 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FNDC4Q9H6D8 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FNDC4Q9H6D8 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FNDC4Q9H6D8 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
FNDC4Q9H6D8 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FNDC4Q9H6D8 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FNDC4Q9H6D8 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FNDC4Q9H6D8 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FNDC4Q9H6D8 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FNDC4Q9H6D8 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FNDC4Q9H6D8 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
FNDC4Q9H6D8 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FNDC4Q9H6D8 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FNDC4Q9H6D8 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FNDC4Q9H6D8 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FNDC4Q9H6D8 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FNDC4Q9H6D8 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FNDC4Q9H6D8 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FNDC4Q9H6D8 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FNDC4Q9H6D8 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FNDC4Q9H6D8 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FNDC4Q9H6D8 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FNDC4Q9H6D8 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FNDC4Q9H6D8 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FNDC4Q9H6D8 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FNDC4Q9H6D8 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FNDC4Q9H6D8 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
FNDC4Q9H6D8 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FNDC4Q9H6D8 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FNDC4Q9H6D8 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FNDC4Q9H6D8 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FNDC4Q9H6D8 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FNDC4Q9H6D8 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FNDC4Q9H6D8 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FNDC4Q9H6D8 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FNDC4Q9H6D8 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FNDC4Q9H6D8 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FNDC4Q9H6D8 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FNDC4Q9H6D8 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FNDC4Q9H6D8 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FNDC4Q9H6D8 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
FNDC4Q9H6D8 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FNDC4Q9H6D8 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FNDC4Q9H6D8 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
FNDC4Q9H6D8 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FNDC4Q9H6D8 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FNDC4Q9H6D8 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FNDC4Q9H6D8 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FNDC4Q9H6D8 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FNDC4Q9H6D8 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FNDC4Q9H6D8 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FNDC4Q9H6D8 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FNDC4Q9H6D8 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
FNDC4Q9H6D8 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FNDC4Q9H6D8 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FNDC4Q9H6D8 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FNDC4Q9H6D8 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FNDC4Q9H6D8 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FNDC4Q9H6D8 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FNDC4Q9H6D8 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FNDC4Q9H6D8 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FNDC4Q9H6D8 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FNDC4Q9H6D8 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FNDC4Q9H6D8 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FNDC4Q9H6D8 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FNDC4Q9H6D8 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FNDC4Q9H6D8 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FNDC4Q9H6D8 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FNDC4Q9H6D8 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FNDC4Q9H6D8 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FNDC4Q9H6D8 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FNDC4Q9H6D8 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
FNDC4Q9H6D8 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FNDC4Q9H6D8 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FNDC4Q9H6D8 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FNDC4Q9H6D8 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FNDC4Q9H6D8 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FNDC4Q9H6D8 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FNDC4Q9H6D8 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FNDC4Q9H6D8 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FNDC4Q9H6D8 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FNDC4Q9H6D8 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FNDC4Q9H6D8 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
FNDC4Q9H6D8 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
FNDC4Q9H6D8 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FNDC4Q9H6D8 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
FNDC4Q9H6D8 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FNDC4Q9H6D8 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms